HPV疫苗有4价和9价之分，4价适用于9-45岁女性，9价适用于9-45岁男女；4价防6、11、16、18型，9价在此基础上加31、33、45、52、58型；接种程序均为0、2、6月各1剂；9价一般更贵；备孕、怀孕、哺乳期女性接种需注意，对酵母蛋白过敏者禁用，已感染部分亚型者仍可接种。
一、接种年龄区别
1.4价HPV疫苗：适用于9~45岁的女性。
2.9价HPV疫苗：适用于9~45岁的男性和女性。
二、预防病毒亚型区别
1.4价HPV疫苗：可预防6型、11型、16型、18型HPV病毒。其中6型和11型属于低危型，能预防90%的生殖器疣；16型和18型属于高危型，能预防70%的宫颈癌。
2.9价HPV疫苗：在4价的基础上，额外增加了31型、33型、45型、52型、58型HPV病毒。能预防的高危型HPV病毒更多，对宫颈癌的预防效率能达到90%左右，对生殖器疣的预防也有进一步提升。
三、接种程序区别
1.4价HPV疫苗：第0、2、6个月各接种1剂，共接种3剂。
2.9价HPV疫苗：也是第0、2、6个月各接种1剂，共接种3剂。
四、价格区别
一般来说，9价HPV疫苗的价格相对4价HPV疫苗会高一些，这主要是因为9价能预防的病毒亚型更多，但具体价格会因地区、接种机构等因素有所不同。
特殊人群注意事项
1.备孕、怀孕及哺乳期女性：
对于备孕女性，若正在接种HPV疫苗，建议推迟接种计划，待完成整个接种程序后再考虑备孕。因为目前关于HPV疫苗在备孕期间接种对胎儿影响的长期数据有限，为谨慎起见，选择推迟接种。
怀孕女性不建议接种HPV疫苗，若在接种期间发现怀孕，应暂停接种，待分娩后再继续完成剩余剂次的接种。
哺乳期女性接种HPV疫苗后，目前没有证据表明会对乳汁分泌及婴儿健康产生不良影响，但出于谨慎，建议在接种前与医生充分沟通，根据自身情况决定是否接种。
2.对蛋白质过敏人群：
4价和9价HPV疫苗中都含有酵母蛋白成分，对酵母蛋白过敏的人群应禁用相应疫苗，以免引发严重过敏反应。在接种前，应详细告知医生自己的过敏史，包括食物过敏、药物过敏等情况，由医生判断是否适合接种HPV疫苗。
3.已经感染过部分HPV亚型的人群：
即使已经感染过4价或9价HPV疫苗所包含的部分亚型病毒，仍然可以接种该疫苗。因为HPV疫苗主要是预防未感染的HPV亚型病毒感染，对于已经感染的亚型，疫苗不能治疗已有的感染，但仍能预防其他未感染的高危和低危亚型病毒感染，降低相关疾病的发生风险。例如，已经感染16型HPV的女性，接种4价或9价HPV疫苗仍能预防58型等其他高危亚型HPV的感染。
