怀孕两三个月自然流产的原因为胚胎因素、母体因素、环境因素等。
1.胚胎因素
胚胎染色体异常是导致早期自然流产常见的原因，约占50%-60%。染色体数目或结构异常会影响胚胎的正常发育，使胚胎无法继续生长，从而发生自然流产。此外，胚胎发育异常，如胚胎畸形、胚胎生长受限等，也可能导致流产。
2.母体因素
母体患有全身性疾病，如严重感染、高热、贫血、心力衰竭、慢性肝肾疾病等，会影响胚胎的生长发育，增加流产的风险。生殖器官异常，如子宫畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连等，会干扰胚胎着床和发育，导致流产。内分泌失调，如黄体功能不足、甲状腺功能减退等，也会影响妊娠的维持，引发自然流产。
3.环境因素
孕妇接触有害化学物质，如铅、汞、苯、砷等，或放射线、高温、噪音等物理因素，以及某些药物，如抗肿瘤药、抗癫痫药等，都可能影响胚胎发育，导致自然流产。此外，不良的生活习惯，如吸烟、酗酒、过度劳累等，也会增加流产的可能性。
