早晨咳嗽的原因主要有环境因素、感冒、过敏、咽炎、支气管炎等。
1.环境因素
夜间睡眠环境如果存在不良因素，可能刺激呼吸道引发早晨咳嗽。比如空气过于干燥，会使呼吸道黏膜缺水，导致黏膜干燥、受损，容易引发刺激性咳嗽；室内存在粉尘、螨虫、油烟、香水等刺激性气体或过敏原，睡觉时吸入这些物质，会对呼吸道产生持续刺激，经过一夜的积累，早晨起床后便可能出现咳嗽症状；另外，室内温度过低，冷空气刺激呼吸道黏膜，也可能引起咳嗽。
2.感冒
感冒多由病毒感染引起，病毒侵袭呼吸道后，会导致呼吸道黏膜充血、水肿，分泌物增多。夜间睡觉时，呼吸道内的分泌物会逐渐积聚，早晨起床后，体位发生变化，分泌物刺激气管或支气管黏膜，就会引起咳嗽，以排出呼吸道内的分泌物。同时，感冒还可能伴有鼻塞、流涕、咽痛、发热等症状。
3.过敏
对于过敏体质的人来说，早晨咳嗽可能与过敏有关。常见的过敏原包括花粉、尘螨、动物皮屑等。夜间睡觉时，床上的尘螨、动物皮屑等过敏原可能被吸入呼吸道，引起呼吸道过敏反应，导致呼吸道黏膜水肿、分泌物增加，从而引发咳嗽。这种咳嗽多为刺激性干咳，可能还伴有打喷嚏、流鼻涕、皮肤瘙痒等过敏症状，且在接触过敏原后症状会加重。
4.咽炎
患有咽炎时，咽喉部黏膜处于炎症状态，会出现充血、肿胀、分泌物增多等情况。夜间睡眠时，咽喉部的分泌物会逐渐积聚，且由于夜间吞咽动作减少，分泌物对咽喉部的刺激持续存在。早晨起床后，受到分泌物的刺激以及体位变化的影响，就会出现咳嗽症状，以清除咽喉部的分泌物。咽炎引起的咳嗽多伴有咽部不适、异物感、咽痛、咽干等症状。
5.支气管炎
支气管炎患者的支气管黏膜存在炎症，会导致分泌物增多，形成痰液。夜间睡觉时，由于体位的原因，痰液容易在支气管内积聚，早晨起床后，随着体位的改变和身体的活动，痰液刺激支气管黏膜，引起咳嗽反射，从而出现咳嗽症状，以排出痰液。支气管炎引起的咳嗽可能伴有咳痰，痰液可为白色黏液痰或黄色脓痰，病情严重时还可能出现胸闷、气短等症状。
