腺癌确切病因未完全明确，但有相关高危因素，包括遗传因素如林奇综合征、家族性腺瘤性息肉病相关基因突变；慢性炎症刺激如胆道腺癌与原发性硬化性胆管炎、胃腺癌与幽门螺杆菌感染的慢性炎症；环境因素中化学致癌物质及吸烟的影响；生活方式因素里不合理饮食、肥胖的作用；还有病毒感染如乙肝病毒致肝细胞癌、HPV高危型别致宫颈癌等腺癌。
遗传因素：某些遗传性综合征与腺癌的发生密切相关。例如，林奇综合征（遗传性非息肉病性结直肠癌综合征）患者患结直肠腺癌的风险显著增加，该综合征是由于错配修复基因（如MLH1、MSH2等）的种系突变引起，这些基因突变会导致DNA修复功能缺陷，使细胞在增殖过程中容易积累基因突变，进而引发腺癌。在家族性腺瘤性息肉病中，患者因APC基因的突变，肠道内会形成大量腺瘤性息肉，随着时间推移，部分息肉可能恶变为腺癌，这类患者具有明显的家族遗传倾向，一级亲属患该病的风险显著高于普通人群。
慢性炎症刺激：长期的慢性炎症可能诱发腺癌。以胆道腺癌为例，慢性胆道炎症，如原发性硬化性胆管炎患者，由于胆道长期处于炎症状态，胆管上皮细胞不断受到损伤-修复的刺激，细胞增殖失控，增加了腺癌发生的风险。在慢性胃炎基础上发展而来的胃腺癌也较为常见，幽门螺杆菌感染引起的慢性胃炎，长期的炎症刺激导致胃黏膜上皮细胞发生异型增生，逐步进展为腺癌。
环境因素
化学致癌物质：长期接触某些化学致癌物质与腺癌发生相关。例如，长期接触石棉的工人患胸膜腺癌的风险增加；长期暴露于多环芳烃类化合物，如在某些工业生产环境中，工人接触到煤焦油、沥青等，这些物质中的多环芳烃可通过多种机制损伤细胞DNA，导致基因突变，引发腺癌。
吸烟：吸烟不仅与肺癌相关，也与其他部位的腺癌有关。吸烟产生的烟雾中含有多种致癌物质，如苯并芘等，这些物质可通过呼吸道进入人体，影响肺、胰腺等器官的上皮细胞，增加腺癌的发生风险。有研究表明，长期吸烟者患胰腺癌的风险明显高于不吸烟者。
生活方式因素
饮食：不合理的饮食结构与腺癌发生有关。长期高脂肪、低纤维饮食是结直肠癌的危险因素，高脂肪饮食会改变肠道菌群结构，产生更多的致癌物质，同时低纤维饮食使肠道蠕动减慢，致癌物质在肠道内停留时间延长，增加对肠黏膜的刺激；过量饮酒与肝癌、胰腺癌等腺癌的发生相关，酒精在体内代谢产生的乙醛具有致癌性，长期大量饮酒可损伤肝细胞，引起肝硬化，进而增加肝癌的发生风险。
肥胖：肥胖是多种腺癌的危险因素，尤其是结直肠癌、胰腺癌、乳腺癌等。肥胖者体内脂肪细胞分泌的瘦素、脂联素等脂肪因子失衡，胰岛素抵抗增加，胰岛素样生长因子-1水平升高，这些因素均可促进细胞增殖，抑制细胞凋亡，从而增加腺癌的发生几率。
病毒感染：某些病毒感染与腺癌的发生相关。例如，乙肝病毒（HBV）感染与肝细胞癌密切相关，HBV感染引起肝细胞炎症、坏死，在修复过程中肝细胞不断增殖，病毒的基因整合到宿主肝细胞DNA中，导致基因表达异常，增加肝细胞癌变的风险；人乳头瘤病毒（HPV）的某些高危型别感染与宫颈癌、肛门腺癌等有关，HPV病毒的E6和E7蛋白可结合并灭活p53和Rb等肿瘤抑制基因，使细胞生长失控，引发癌变。
