心肌炎的病因主要有病毒感染、细菌感染、真菌和寄生虫感染、药物和毒物反应、自身免疫性疾病等。
1.病毒感染
这是常见病因，像柯萨奇病毒、埃可病毒、脊髓灰质炎病毒等肠道病毒，以及流感病毒、腺病毒、巨细胞病毒等，感染人体后可通过直接侵袭心肌细胞，或引发免疫反应损伤心肌，导致心肌炎。
2.细菌感染
如白喉杆菌、链球菌、脑膜炎球菌等细菌感染，产生的毒素可直接损害心肌，或引发免疫反应间接影响心肌，进而引发心肌炎。
3.真菌和寄生虫感染
念珠菌、曲霉菌等真菌，以及弓形虫、锥虫等寄生虫感染，也可能侵犯心肌，造成心肌炎症。
4.药物和毒物反应
某些抗生素、抗精神病药、化疗药物等，以及酒精、重金属等毒物，可引起心肌过敏反应或毒性作用，导致心肌炎。
5.自身免疫性疾病
如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，免疫系统错误攻击自身心肌组织，引发心肌炎。
