十二指肠脂肪瘤发病原因包括先天发育因素（胚胎发育组织异常分化致脂肪异常聚集）、遗传因素（某些遗传性综合征增加风险且家族有相关病史者发病几率相对高）、慢性炎症刺激作用（长期十二指肠黏膜慢性炎症致脂肪异常增生）、生活方式因素（饮食上长期高脂饮食易致风险高，不良生活习惯如吸烟酗酒破坏胃肠道内环境稳态间接促进发病）。
一、先天发育因素
十二指肠脂肪瘤的发生可能与胚胎发育过程中的组织异常分化相关。在胚胎时期，原始组织的分化出现偏差，导致脂肪组织在十二指肠部位异常聚集形成脂肪瘤，这种先天发育的异常是十二指肠脂肪瘤发生的基础因素之一，且不受年龄、性别等特定人群的绝对限制，所有人群都可能因胚胎发育阶段的异常而面临该风险。
二、遗传因素影响
某些遗传性综合征可能增加十二指肠脂肪瘤的发病风险。例如，存在与脂肪代谢相关的基因变异等遗传因素时，个体的遗传背景使得其在十二指肠部位更容易出现脂肪组织的异常增生形成脂肪瘤。家族中有相关遗传病史的人群，相较于无家族遗传史的人群，十二指肠脂肪瘤的发病几率可能相对更高，这体现了遗传因素在发病原因中的作用，不同家族遗传特征的人群发病风险存在差异。
三、慢性炎症刺激作用
长期的十二指肠黏膜慢性炎症是导致十二指肠脂肪瘤的重要原因之一。胃肠道内的慢性炎症会持续刺激十二指肠局部的组织细胞，使得细胞的增殖、分化等生物学行为发生改变，进而促使脂肪组织异常增生并在十二指肠部位形成脂肪瘤。有胃肠道慢性炎症病史的人群，如既往患有十二指肠溃疡等疾病未得到有效控制，炎症长期存在，就会增加十二指肠脂肪瘤的发病风险，不同炎症持续时间和严重程度的人群，受此因素影响的发病风险程度不同。
四、生活方式因素影响
1.饮食因素：长期高脂饮食会影响体内脂肪代谢平衡。过多摄入高脂食物使得体内脂肪含量升高，多余的脂肪可能在十二指肠部位异常聚集形成脂肪瘤。例如，长期大量食用油炸食品、动物内脏等高脂食物的人群，相较于饮食清淡、低脂的人群，十二指肠脂肪瘤的发病风险更高。
2.不良生活习惯：长期吸烟、酗酒等不良生活习惯会破坏胃肠道内环境稳态。烟草中的有害物质和酒精都会对胃肠道黏膜产生刺激，影响胃肠道的正常生理功能，间接促进十二指肠部位脂肪组织的异常增生，从而增加十二指肠脂肪瘤的发病几率。吸烟人群和酗酒人群相较于不吸烟不酗酒人群，受该因素影响发病风险更高。
