右侧卵巢囊肿对怀孕的影响因类型而异，生理性囊肿影响较小，病理性囊肿较大或为赘生性时影响较大。
如果右侧卵巢囊肿是生理性的，如滤泡囊肿或黄体囊肿，通常直径较小，一般不会对怀孕产生影响。生理性囊肿多会在月经周期的特定阶段出现，随着月经周期的变化可能会自行消失，不会影响卵巢的正常排卵功能和输卵管的通畅性，所以对怀孕没有明显影响。
但是，当右侧卵巢囊肿为病理性且体积较大时，可能会压迫卵巢组织，影响卵巢的正常排卵功能，导致排卵障碍，从而降低受孕几率。如果囊肿发生扭转或破裂，会引起急性腹痛等严重症状，需要及时手术治疗，手术可能会损伤卵巢组织，影响卵巢功能，进而影响怀孕。
此外，某些卵巢囊肿，如卵巢巧克力囊肿，是子宫内膜异位症的一种表现，会影响盆腔环境，导致盆腔粘连，影响输卵管的功能，也会增加不孕的风险。
