射精后尿道口疼痛的原因包括感染因素（如尿道炎的细菌性、淋菌性、非淋菌性及前列腺炎的细菌性、慢性非细菌性）、机械性因素（如性生活过于剧烈、使用不当避孕方式、尿道结石或狭窄）、其他因素（如过敏反应包括对精液过敏和局部接触性过敏、全身性疾病如糖尿病、痛风）。
一、感染因素
（一）尿道炎
细菌性尿道炎：多由大肠埃希菌等细菌感染引起，性生活不卫生、尿道损伤等可增加感染风险。细菌侵袭尿道黏膜，导致黏膜充血、水肿，射精时尿道肌肉收缩，刺激受损黏膜引发疼痛，常见于有不洁性行为或不注意个人卫生的人群。
淋菌性尿道炎：由淋病奈瑟菌感染所致，主要通过性接触传播，是我国常见的性传播疾病之一。感染后尿道黏膜炎症反应明显，射精时尿道收缩会出现疼痛，男性患者多有尿频、尿急、尿道口脓性分泌物等表现。
非淋菌性尿道炎：主要由沙眼衣原体、解脲脲原体等感染引起，性接触是主要传播途径，其发病较淋病缓慢，症状相对较轻，但也会导致尿道黏膜炎症，射精时出现尿道口疼痛，可伴有尿道刺痒、少量黏液性分泌物等。
（二）前列腺炎
细菌性前列腺炎：致病菌多为大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌等，可通过血行感染、淋巴感染或尿道逆行感染等途径引发。前列腺发生炎症时，射精时前列腺平滑肌收缩，刺激炎症部位导致尿道口疼痛，同时可伴有尿频、尿急、会阴区坠胀等症状，常见于长期久坐、憋尿、有不洁性生活史的人群。
慢性非细菌性前列腺炎：病因尚不十分明确，可能与病原体感染、排尿功能障碍、精神心理因素、免疫反应异常等有关。前列腺长期处于炎症状态，射精时前列腺收缩引起尿道口疼痛，症状可反复发作，影响患者生活质量，多见于中青年男性。
二、机械性因素
（一）性生活因素
性生活过于剧烈：性生活时动作粗暴、频率过高或时间过长，可导致尿道黏膜受损，射精时引起尿道口疼痛，这种情况在性生活不节制的人群中较为常见。
使用不当的避孕方式：如使用刺激性较强的避孕套或避孕药膏等，可能引起尿道局部过敏或刺激反应，射精时出现疼痛，对特定材质或成分过敏的人群易发生。
（二）尿道结石或狭窄
尿道结石：尿道狭窄处或尿道憩室易形成结石，结石刺激尿道黏膜，射精时由于尿道肌肉收缩，结石移动摩擦黏膜导致疼痛，可伴有排尿困难、血尿等表现，有尿道损伤病史或代谢异常的人群易长尿道结石。
尿道狭窄：多由尿道损伤、炎症、先天性尿道狭窄等引起，尿道管径变窄，射精时尿液或精液通过狭窄部位受阻，造成尿道口疼痛，常见于有尿道外伤史或尿道感染反复发作的患者。
三、其他因素
（一）过敏反应
对精液过敏：少数男性对自身精液过敏，射精后免疫系统对精液中的某些成分产生过敏反应，引起尿道口及周围组织的炎症反应，出现疼痛、瘙痒、红肿等表现，这种情况相对少见，但一旦发生症状较明显。
局部接触性过敏：接触某些过敏原，如新换的内裤材质、洗涤剂等，射精后尿道口接触到相关过敏原，引发过敏反应导致疼痛，有过敏体质的人群更易发生。
（二）全身性疾病
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，容易发生泌尿系统感染，进而可能出现射精后尿道口疼痛，同时伴有多饮、多食、多尿、体重减轻等糖尿病典型症状，长期高血糖环境有利于细菌生长繁殖，增加感染风险。
痛风：血尿酸水平升高，尿酸盐结晶沉积在尿道等组织，可引起局部炎症反应，射精时刺激炎症部位导致尿道口疼痛，多见于有痛风家族史、长期高嘌呤饮食的人群。
