背部肩胛骨区域疼痛的原因包括肌肉骨骼相关和神经系统相关及内脏疾病牵涉痛。肌肉骨骼相关有肌肉劳损（长期不良姿势致肩胛骨周围肌肉劳损）、筋膜炎（受凉、外伤、过度劳累诱发）、肩周炎后期累及、骨折（肩部外伤致）；神经系统相关是颈椎病（颈椎病变压迫神经根致放射性疼痛）；内脏疾病牵涉痛有心肺疾病（如心绞痛、心肌梗死、胸膜炎致牵涉痛），不同人群因不同生活方式等因素有不同发病情况。
筋膜炎：背部肩胛骨部位的筋膜发生无菌性炎症也会引起疼痛。多因受凉、外伤、过度劳累等因素诱发。寒冷刺激会使筋膜血管收缩，血液循环不畅，代谢产物堆积，引发炎症反应；外伤可能直接损伤筋膜组织，导致炎症发生；过度劳累则会使筋膜反复受到牵拉，引起劳损性炎症。各年龄段均可发病，不同生活方式的人群都有患病可能，比如经常进行重体力劳动的人群，筋膜承受的压力较大，更容易患筋膜炎。
肩周炎：肩周炎后期可能会累及背部肩胛骨区域，导致疼痛。肩周炎主要是肩关节周围的肌肉、肌腱、滑囊及关节囊等软组织的慢性炎症，炎症逐渐蔓延可能波及肩胛骨周围组织。多见于50岁左右人群，女性相对男性发病率稍高，与肩关节长期过度活动、姿势不良等生活方式有关。
骨折：肩部受到外伤，如摔倒时肩部着地、重物撞击等，可能导致肩胛骨骨折，从而引起疼痛。这种情况在有外伤史的人群中发生，不同年龄都可能出现，儿童可能因意外摔倒等，成年人可能因交通事故、高处坠落等导致骨折。
神经系统相关原因
颈椎病：当颈椎发生病变，如颈椎间盘突出、骨质增生等，压迫神经根时，可能会引起背部肩胛骨区域的放射性疼痛。颈椎病的发生与长期低头、颈椎退变等因素有关，长期伏案工作、使用电子设备的人群患病风险较高，各年龄段都可能发病，随着年龄增长，颈椎退变的概率增加，发病风险也相应提高。
内脏疾病牵涉痛
心肺疾病：某些心肺疾病可引起背部肩胛骨区域的牵涉痛。例如心绞痛、心肌梗死时，疼痛可放射至背部肩胛骨附近；胸膜炎也可能导致背部肩胛骨区域疼痛。心肺疾病引起的牵涉痛在中老年人群中相对常见，有心血管疾病家族史、长期吸烟等不良生活方式的人群患病风险更高。
