卵泡囊肿形成与卵泡发育异常（正常卵泡排卵障碍、卵泡过度刺激）、激素水平波动（雌激素水平影响、促性腺激素失衡）及其他因素（炎症影响、子宫内膜异位症相关）有关，如正常月经周期中卵泡未正常排卵、使用促排卵药物致卵泡过度发育、雌激素水平异常波动、促性腺激素失衡、盆腔炎症波及卵巢、子宫内膜异位症累及卵巢等都可引发卵泡囊肿。
卵泡发育异常
正常卵泡排卵障碍：在正常的月经周期中，卵泡会逐渐发育成熟，然后排卵。如果卵泡成熟后没有正常排卵，卵泡就会持续增大形成囊肿。例如，女性的内分泌系统如果出现紊乱，可能影响卵泡的正常排卵过程，导致卵泡囊肿的形成。对于不同年龄段的女性，内分泌的稳定程度不同，青春期女性内分泌调节机制尚不完善，围绝经期女性内分泌波动较大，都相对更容易出现卵泡发育异常相关的卵泡囊肿。
卵泡过度刺激：某些情况下，如使用促排卵药物等，可能会导致多个卵泡同时过度发育，进而形成囊肿。对于有生育需求使用促排卵药物的女性，需要密切监测卵泡发育情况，因为促排卵药物的使用可能增加卵泡囊肿形成的风险。
激素水平波动
雌激素水平影响：雌激素对卵泡的发育和成熟起着重要作用。当体内雌激素水平出现异常波动时，可能干扰卵泡的正常生长和排卵过程。例如，长期的精神压力过大、生活不规律等因素可能影响激素的分泌，导致雌激素水平波动，增加卵泡囊肿发生的可能性。不同生活方式的女性，如长期熬夜、作息不规律的女性，激素水平更容易出现波动，从而增加卵泡囊肿风险。
促性腺激素失衡：促性腺激素包括促卵泡生成素和促黄体生成素等，它们的失衡会影响卵泡的正常发育。当促卵泡生成素和促黄体生成素的比例失调时，卵泡可能无法正常排卵而形成囊肿。对于患有一些内分泌疾病的女性，如多囊卵巢综合征患者，往往存在促性腺激素的失衡，这也是该类患者容易出现卵泡囊肿的重要原因之一。
其他因素
炎症影响：盆腔炎症等可能波及卵巢，影响卵泡的正常结构和功能，导致卵泡囊肿形成。有盆腔炎症病史的女性，卵泡囊肿的发生风险相对较高。在炎症的刺激下，卵巢局部的微环境改变，影响卵泡的正常发育和排卵，进而促使卵泡囊肿形成。
子宫内膜异位症相关：子宫内膜异位症可累及卵巢，异位的子宫内膜组织可能影响卵泡的正常生长和排卵，增加卵泡囊肿的发生几率。患有子宫内膜异位症的女性，需要关注卵泡的情况，因为该病与卵泡囊肿的形成存在一定关联。子宫内膜异位症会导致卵巢组织的异常改变，干扰卵泡的正常生理过程，从而引发卵泡囊肿。
