维生素B12缺乏可由摄入不足、吸收障碍、需要量增加等因素引起。摄入不足包括严格素食者因缺乏动物性食物来源及老年人、婴幼儿因胃肠功能或喂养问题导致；吸收障碍与胃肠道疾病（如萎缩性胃炎、胃大部切除术后）、肠道疾病（如克罗恩病、热带口炎性腹泻）有关；需要量增加见于生长发育阶段（儿童、孕妇、哺乳期女性）及某些疾病状态（恶性贫血、甲状腺功能亢进患者）
一、摄入不足
1.饮食因素：严格素食者易缺维生素B12，因为维生素B12主要存在于动物性食物中，如肉类、蛋类、奶制品等，长期不摄入这类食物则会导致摄入不足。例如，完全依靠植物性食物为主食的人群，由于植物性食物中维生素B12含量极低，较易出现维生素B12缺乏情况。
2.年龄与营养吸收：老年人胃肠功能减退，胃酸分泌减少，会影响维生素B12的吸收；婴幼儿若喂养不当，如母乳中维生素B12含量不足且未及时添加富含维生素B12的辅食，也易导致摄入不足。比如，母乳喂养的婴儿，如果母亲本身维生素B12摄入不足，那么母乳中的含量也会降低，若未及时添加富含维生素B12的配方奶或辅食，婴儿就容易缺乏。
二、吸收障碍
1.胃肠道疾病：一些胃肠道疾病会影响维生素B12的吸收，如萎缩性胃炎、胃大部切除术后等。萎缩性胃炎患者胃黏膜萎缩，胃酸和内因子分泌减少，内因子缺乏会影响维生素B12与内因子结合进而影响吸收；胃大部切除术后，胃的结构和功能改变，也会导致维生素B12吸收障碍。例如，胃大部切除术后的患者，由于胃内因子分泌减少，维生素B12吸收减少，长期可导致缺乏。
2.肠道疾病：像克罗恩病、热带口炎性腹泻等肠道疾病也会干扰维生素B12的吸收。克罗恩病可引起肠道黏膜炎症、溃疡等病变，影响肠道对营养物质包括维生素B12的吸收；热带口炎性腹泻患者肠道功能紊乱，也会导致维生素B12吸收不良。
三、需要量增加
1.生长发育阶段：儿童处于生长发育快速阶段，孕妇在孕期以及哺乳期的女性，对维生素B12的需要量增加。儿童身体快速生长，各种代谢活动旺盛，需要更多的维生素B12参与细胞合成等过程；孕妇孕期胎儿生长发育需要维生素B12，哺乳期女性不仅自身需要维持正常生理功能，还要通过乳汁提供给婴儿，所以对维生素B12的需要量显著增加。比如，青少年生长发育时期，如果日常饮食中维生素B12摄入不能满足快速增长的需要量，就容易缺乏。
2.某些疾病状态：一些慢性疾病患者，如恶性贫血患者，由于自身免疫系统攻击胃黏膜细胞，导致内因子缺乏，即使摄入正常量的维生素B12也难以吸收，同时身体处于疾病消耗状态，需要量相对增加；甲状腺功能亢进患者代谢加快，也会使维生素B12的需要量增多。
