小脑萎缩后期会引发运动功能障碍、言语障碍、认知与精神症状及自主神经功能紊乱等问题，运动功能障碍表现为步态异常、肢体精细动作困难等；言语障碍为说话含糊不清等；部分患者有认知功能下降、抑郁焦虑等精神症状；还会出现血压异常、出汗异常等自主神经功能紊乱表现，不同年龄段患者受影响情况各异。
言语障碍
小脑与言语中枢的协调相关，后期患者会出现言语障碍。表现为说话含糊不清，语速快慢不均，发音不准，难以流畅表达自己的意思。这是因为小脑受损后，无法协调咽喉部肌肉及相关神经来完成正常的言语功能，年龄不同的患者受影响程度不同，老年患者可能因基础健康状况较差，言语障碍会进一步影响其社交沟通，而儿童患者可能导致学习语言的困难，影响其语言发育进程。
认知与精神症状
部分小脑萎缩后期患者会出现认知与精神方面的改变。认知功能下降，表现为记忆力减退，尤其是近期记忆力，很难记住刚发生的事情。还可能出现注意力不集中等情况。精神症状方面，可能会有抑郁、焦虑等情绪问题，患者情绪低落，对周围事物缺乏兴趣，或者出现无端的焦虑不安。这是因为小脑萎缩可能影响了相关脑区的功能，进而波及认知和精神调控区域，对于有基础精神疾病病史的患者，这种认知与精神症状的出现可能会加重原有病情，而儿童患者若出现此类症状，会严重影响其学习和心理发展。
自主神经功能紊乱
后期患者可能出现自主神经功能紊乱的表现。比如血压异常，可能出现体位性低血压，患者从卧位或坐位站起时，血压迅速下降，出现头晕、眼前发黑等症状。还可能有出汗异常，表现为多汗或盗汗。这是由于小脑萎缩影响了自主神经系统的调节功能，对于老年患者，本身自主神经功能就相对较弱，体位性低血压可能导致跌倒受伤等风险增加，而儿童患者出现自主神经功能紊乱可能影响其正常的生理调节，对身体发育产生不良影响。
