肝吸虫病有急性期和慢性期症状，急性期部分患者数天至1个月左右出现，有发热、腹痛、腹泻等；慢性期有消化系统症状如消化不良、腹痛、黄疸，营养不良相关症状如消瘦，肝胆系统相关症状如肝大、胆囊炎、胆管炎，不同人群症状有差异。
一般情况：部分患者在感染肝吸虫后数天至1个月左右进入急性期，儿童和青少年相对更易出现明显症状，可能与自身免疫反应等因素有关。一般会有发热表现，体温可在38℃-39℃左右，这是因为机体对寄生虫感染产生免疫应答，引发炎症反应导致体温调节中枢紊乱。
消化道症状：会出现腹痛，多为上腹部隐痛或钝痛，疼痛程度不一，部分患者还会有腹泻，每日腹泻次数不等，可能与寄生虫在肠道内寄生，影响肠道正常消化吸收功能有关，粪便多为稀便，少数可能带有黏液。
慢性期症状
消化系统症状
消化不良：较为常见，患者会有食欲减退，对食物的摄取量减少，这是因为肝吸虫寄生在胆道系统，影响胆汁的分泌和排泄，进而影响食物的消化，尤其是对脂肪的消化吸收。还可能出现腹胀，上腹部有饱胀感，进食后更为明显。
腹痛：多为右上腹或上腹部隐痛、胀痛或钝痛，疼痛无明显规律性，时轻时重，这是由于胆道内寄生虫的刺激，导致胆道平滑肌痉挛或胆道炎症引起。
黄疸：少数患者可能出现黄疸，表现为皮肤和巩膜黄染，这是因为肝吸虫大量寄生在胆道，引起胆道梗阻，胆汁排泄不畅，胆红素反流入血导致。儿童患者出现黄疸时需格外关注，因为儿童的肝脏代谢功能相对较弱，黄疸可能对肝脏功能影响更大。
营养不良相关症状：长期患病的患者可能出现营养不良，表现为消瘦，体重下降，这是因为肝吸虫寄生消耗人体营养，同时影响消化吸收功能，导致营养物质摄入不足和吸收不良。儿童患者若发生营养不良，会影响其生长发育，导致身高、体重增长缓慢等问题。
肝胆系统相关症状：
肝大：多数患者有肝大表现，尤以左叶肝大更为常见，可通过腹部触诊发现肝脏质地中等，有轻度压痛。这是因为寄生虫在胆道内寄生，引起胆管炎、胆管周围炎，进而导致肝脏炎性病变和组织增生。
胆囊炎、胆管炎：反复出现右上腹疼痛，可伴有发热、寒战等症状，这是由于胆道内寄生虫的刺激，引发胆道的炎症反应，炎症反复发作可导致胆囊和胆管的慢性病变。
不同人群感染肝吸虫病后的症状可能会有所差异，例如老年人由于机体功能衰退，症状可能相对不典型，发热、腹痛等表现可能不如年轻人明显，但肝脏功能损害可能相对更易出现；女性患者在妊娠期感染肝吸虫病，需要考虑对胎儿的影响，因为寄生虫感染可能通过影响母体营养状况等间接影响胎儿发育，同时在用药等方面需要更加谨慎，因为很多药物在妊娠期使用受限。
