真菌性脑膜炎由真菌侵犯脑膜引起，常见病因包括病原体感染（如新型隐球菌、曲霉菌、毛霉菌等）、医源性因素（如颅脑手术、腰椎穿刺等有创操作）、基础疾病影响（如免疫功能低下、慢性疾病等导致机体免疫力降低而易受真菌侵袭引发脑膜炎）。
病原体感染
新型隐球菌：是引起真菌性脑膜炎最常见的病原体。新型隐球菌广泛存在于自然界，如土壤、鸽粪等环境中。健康人通常可接触到新型隐球菌，但一般不会发病，当人体免疫力下降时，例如患有艾滋病、糖尿病、恶性肿瘤等基础疾病，或者长期使用免疫抑制剂、广谱抗生素等，新型隐球菌就可能趁机侵入人体，并通过血液循环到达脑膜，引起脑膜炎症。对于儿童来说，如果存在先天性免疫缺陷等情况，也容易受到新型隐球菌的侵袭引发真菌性脑膜炎。
曲霉菌：曲霉菌也是导致真菌性脑膜炎的病原体之一。曲霉菌在环境中分布较广，可通过呼吸道吸入曲霉菌孢子，然后孢子在体内播散，当播散至脑膜时可引起炎症。一些有肺部曲霉菌感染基础的患者，或者长期住院、接受有创操作且免疫力低下的人群，发生曲霉菌播散至脑膜引发真菌性脑膜炎的风险增加。
毛霉菌：毛霉菌引起真菌性脑膜炎相对较少见，但一旦发生病情往往较为严重。毛霉菌感染多与患者免疫力极度低下有关，比如患有白血病且化疗后骨髓抑制期、严重的烧伤患者等，毛霉菌可通过血管侵入脑膜，导致脑膜炎症。
医源性因素
颅脑手术：进行颅脑手术时，如果手术环境消毒不严格，或者术后患者的脑膜防御屏障受到破坏，就可能使真菌有机会侵入脑膜引发感染。例如，一些复杂的颅脑肿瘤手术、颅脑外伤手术等，术后发生真菌性脑膜炎的风险相对较高。对于儿童患者，由于其颅脑手术的特殊性以及自身免疫力相对较低，术后医源性感染真菌性脑膜炎的风险也需要密切关注。
腰椎穿刺等有创操作：腰椎穿刺等有创操作如果操作过程中无菌观念不强，或者患者本身存在局部感染灶，真菌可能通过操作部位侵入脑膜。尤其是对于本身免疫力较差的患者，如老年患者伴有多种基础疾病时，进行腰椎穿刺等有创操作后发生真菌性脑膜炎的可能性增加。
基础疾病影响
免疫功能低下：如前面提到的艾滋病患者，由于人体免疫缺陷病毒破坏了机体的免疫系统，使得机体对真菌的抵抗力大幅下降，极易发生各种真菌感染，包括真菌性脑膜炎。糖尿病患者如果血糖控制不佳，长期处于高血糖状态会影响机体的免疫功能，也容易遭受真菌的侵袭。恶性肿瘤患者在接受化疗、放疗等治疗过程中，往往会导致骨髓抑制、免疫功能受损，从而增加了真菌性脑膜炎的发病风险。儿童如果患有先天性免疫缺陷病，其自身的免疫防御机制存在缺陷，相比正常儿童更容易受到真菌的感染而引发脑膜炎。
慢性疾病：一些慢性疾病如严重的肺结核患者，由于长期患病导致身体虚弱、免疫力降低，也可能并发真菌性脑膜炎。慢性肝病患者肝功能受损，会影响机体的免疫功能和营养状态等，使得机体对真菌的抵御能力下降，增加了真菌性脑膜炎的发病几率。
