月经期偏头痛受激素变化、神经递质、遗传、生活方式及个体病史等多因素影响，雌激素波动、孕激素变化等激素因素会影响神经递质等进而诱发偏头痛，家族遗传增加患病风险，睡眠质量、饮食、压力情绪等生活方式因素可诱发，既往偏头痛病史及某些基础疾病史也会增加月经期偏头痛发生几率。
孕激素变化：孕激素水平在月经期也会改变，有观点认为孕激素的波动可能通过影响神经递质等多种途径参与月经期偏头痛的发生。比如，孕激素的变化可能影响5-羟色胺等神经递质的代谢，而5-羟色胺等神经递质与偏头痛的发生密切相关。
神经递质因素
5-羟色胺水平改变：5-羟色胺是一种重要的神经递质，在调节血管舒缩、神经传导等方面发挥作用。在月经期，女性体内5-羟色胺水平可能出现异常。有研究发现，月经期偏头痛患者脑内5-羟色胺的代谢和功能可能存在紊乱，这会影响神经系统的正常调节，进而引发偏头痛。例如，5-羟色胺减少可能导致颅内血管收缩功能异常，引发头痛。
其他神经递质影响：除了5-羟色胺外，去甲肾上腺素等神经递质也可能参与其中。月经期体内激素的变化会影响这些神经递质的合成、释放和代谢，从而干扰神经传导，增加偏头痛发生的风险。
遗传因素
家族遗传倾向：如果家族中有偏头痛病史，尤其是女性亲属有月经期偏头痛的情况，那么其他女性成员患月经期偏头痛的风险可能会增加。研究显示，遗传因素可能通过影响个体的神经递质代谢、血管调节等多种生理过程，使个体更容易在月经期发生偏头痛。例如，某些基因的突变或多态性可能与月经期偏头痛的易感性相关，这些基因可能影响血管的结构和功能以及神经递质的调控等。
生活方式因素
睡眠质量：月经期女性的睡眠质量可能受到影响，如睡眠不足或睡眠紊乱。有研究发现，睡眠问题与偏头痛的发生密切相关。在月经期，睡眠质量差可能通过影响身体的内分泌、神经调节等多方面，诱发偏头痛。例如，睡眠不足会导致身体的应激反应增强，激素分泌失衡，从而增加偏头痛的发生几率。
饮食因素：某些食物可能在月经期诱发偏头痛。例如，富含酪胺的食物（如奶酪、巧克力等）、含有亚硝酸盐的食物（如腌制品等）以及过量饮酒等，都可能成为月经期偏头痛的诱因。因为这些食物可能影响血管舒缩功能或神经递质的代谢，在月经期女性身体较为敏感的情况下，容易引发偏头痛。
压力与情绪：月经期女性可能面临来自工作、生活等多方面的压力，情绪也容易波动。长期的压力和不良情绪会通过神经-内分泌系统影响身体的生理功能，导致体内激素失衡、神经递质紊乱等，从而增加月经期偏头痛的发生风险。例如，长期处于高压力状态下的女性，在月经期更容易出现偏头痛症状。
个体病史因素
既往偏头痛病史：如果女性既往有偏头痛病史，那么在月经期时，偏头痛复发的可能性相对较高。因为既往的偏头痛病理生理基础可能仍然存在，在月经期激素变化、神经递质紊乱等因素的触发下，更容易再次引发偏头痛。例如，既往偏头痛患者脑内的神经调节机制可能已经存在一定程度的异常，月经期的相关变化会进一步激活这种异常机制导致头痛发作。
其他疾病史：某些基础疾病也可能与月经期偏头痛的发生相关。例如，有癫痫病史的女性在月经期发生偏头痛的风险可能增加，因为癫痫和偏头痛可能存在共同的神经生物学机制。另外，有心血管疾病家族史或自身有轻度心血管疾病的女性，在月经期由于激素和神经递质的变化可能影响血管功能，从而更容易出现偏头痛。
