慢性乙型病毒性肝炎病程个体差异大，可分免疫耐受期、免疫清除期、非活动或低复制期、再活动期；年龄方面婴幼儿多处免疫耐受期，成年患者免疫清除期表现典型且不良生活方式可加速进展；性别对病程直接影响小但妊娠时可能有波动；生活方式中饮酒、熬夜、不合理饮食会加速病程；既往不规范治疗或合并其他疾病会使病程复杂或进展加快。
免疫耐受期：此阶段多见于免疫功能尚未健全的婴幼儿时期，机体免疫系统对乙肝病毒抗原识别存在缺陷，病毒大量复制，但肝脏炎症较轻。病程可持续数年甚至数十年，此阶段由于肝脏炎症不明显，患者可能无明显症状，容易被忽视。
免疫清除期：随着机体免疫系统逐渐成熟，开始对乙肝病毒进行清除，此时会出现肝脏炎症活动，表现为转氨酶升高等。病程长短不一，短则数月，长则可达数年至数十年。此阶段如果炎症控制不佳，可能逐渐进展为肝纤维化、肝硬化等。
非活动或低复制期：当机体免疫系统与乙肝病毒处于相对平衡状态时，病毒复制水平较低，肝脏炎症较轻或基本无炎症。此阶段病程相对稳定，部分患者可维持较长时间，但仍有部分患者可能再次进入免疫清除期而病情复发。
再活动期：部分患者在非活动或低复制期可能因某些因素（如机体免疫力下降、合并其他病原体感染等）导致病情再次活动，出现肝脏炎症加重等情况。
年龄因素对病程的影响
婴幼儿时期：如前文所述，婴幼儿多处于免疫耐受期，病程进展相对缓慢，但如果未能及时发现和干预，随着年龄增长进入免疫清除期时，病情可能较快进展。例如，婴幼儿感染乙肝病毒后，若到学龄期或青春期才被发现，可能已经有一定程度的肝脏病变。
成年时期：成年患者的免疫清除期表现可能更为典型，炎症活动相对更易被察觉，如出现乏力、纳差、黄疸等症状。而且成年患者如果合并不良生活方式（如长期酗酒、熬夜等），会加重肝脏损伤，加速病程进展，增加向肝硬化、肝癌转化的风险。
性别因素的潜在影响
一般而言，性别本身对慢性乙型病毒性肝炎病程的直接影响相对较小，但在一些特殊情况中可能有一定作用。例如，女性在妊娠期间，由于机体免疫状态和激素水平的变化，可能影响乙肝病情，部分女性在妊娠后病情可能会有一定波动，如免疫清除期可能更易加重等，但这也存在个体差异。
生活方式的影响
饮酒：长期大量饮酒会明显加重肝脏负担，加速慢性乙型病毒性肝炎向肝纤维化、肝硬化甚至肝癌发展的病程。研究表明，乙肝患者饮酒后，肝脏炎症反应会明显增强，比不饮酒的乙肝患者病情进展更快。
熬夜：长期熬夜会影响机体的免疫调节和肝脏的正常代谢修复功能。乙肝患者长期熬夜后，免疫力下降，更易受到病毒侵袭和其他因素影响，导致病情波动，病程可能加速进展。
不合理饮食：高脂肪、高糖饮食会使肝脏脂肪沉积，加重肝脏负担，对于慢性乙型病毒性肝炎患者，可能促进肝纤维化的发展，影响病程。例如，长期摄入过多油腻食物的乙肝患者，肝脏脂肪变性的概率增加，进而影响肝脏的正常功能和病程。
病史相关影响
既往治疗情况：如果患者既往有不规范的抗病毒治疗史，如擅自停药等，可能导致病毒反弹，病情复发，使病程变得复杂，加速肝脏病变进展。例如，患者在抗病毒治疗一段时间后自行停药，会出现病毒载量迅速回升，肝脏炎症再次加重，病程从相对稳定阶段进入活动期。
合并其他疾病：如果慢性乙型病毒性肝炎患者合并丙型肝炎病毒感染、艾滋病病毒感染等其他病毒感染，会相互影响，加重肝脏损伤，使病程进展加快。同时，合并糖尿病等代谢性疾病的患者，由于代谢紊乱等因素，也会影响肝脏的代谢功能，对慢性乙型病毒性肝炎的病程产生不利影响。
