骨软骨瘤是常见良性骨肿瘤，确切病因未完全明确，主要与遗传因素（约10%-20%患者有家族史，EXT1等基因突变可致软骨细胞异常增殖）、胚胎发育异常（胚胎期软骨正常分化骨化异常致形成瘤样结构）、生长发育因素（生长旺盛期儿童青少年易发病，长骨干骺端因生长活跃易形成）有关，是多种因素综合作用结果，遗传奠定易感性基础，胚胎发育异常是病理基础，生长发育阶段是好发于儿童青少年的重要原因。
遗传因素：约10%-20%的骨软骨瘤患者有家族史，存在遗传倾向。研究发现，某些基因突变可能与骨软骨瘤的发生相关，例如EXT1、EXT2等基因的突变，这些基因与软骨发育相关，突变后可能导致软骨细胞异常增殖，从而引发骨软骨瘤。在有家族遗传背景的人群中，其发生骨软骨瘤的风险较一般人群明显增高，不同性别在遗传易感性上并无显著差异，但家族中有相关病史的个体需更加关注自身骨骼情况。
胚胎发育异常：在胚胎发育过程中，软骨的正常分化和骨化过程出现异常可能导致骨软骨瘤的形成。在胚胎早期，软骨组织的生长和骨化调节失衡，使得部分软骨组织没有正常发育为骨骼的一部分，而是异常增殖形成骨软骨瘤样的结构。这种胚胎发育异常在不同年龄阶段的人群中都可能存在，但更多见于儿童和青少年时期，因为此阶段正是骨骼快速发育的时期，任何微小的发育异常都可能被放大并表现为骨软骨瘤。
生长发育因素：处于生长发育旺盛期的儿童和青少年更容易发生骨软骨瘤。在生长发育过程中，骨骼的生长板区域是软骨生长和骨化的关键部位，若该区域出现异常，就容易引发骨软骨瘤。例如，在长骨的生长板附近，软骨细胞的异常增殖会导致骨软骨瘤的形成，这也是为什么骨软骨瘤多见于四肢长骨的干骺端，因为此处是骨骼生长最活跃的部位。对于儿童和青少年来说，需要注意保持良好的生活方式，保证充足的营养供应，尤其是钙、维生素D等与骨骼发育密切相关的营养素，以维持正常的骨骼生长发育，降低骨软骨瘤的发生风险。
骨软骨瘤的发生是多种因素综合作用的结果，遗传因素奠定了易感性基础，胚胎发育异常是直接的病理基础，而生长发育阶段则是其好发于儿童和青少年的重要原因。
