内生性软骨瘤多数患者无疼痛症状，肿瘤较小时或生长缓慢阶段可能无痛；但肿瘤增大压迫周围组织或发生病理性骨折时会出现疼痛，其是否疼痛与多种因素有关，发现异常病灶应及时检查并采取相应措施。
无痛情况
肿瘤较小时：当内生性软骨瘤体积较小时，通常不会对周围组织产生明显的压迫等刺激，所以患者可能没有疼痛感觉。这种情况在影像学检查偶然发现时较为常见，比如在进行其他部位X线等检查时意外发现骨内有内生性软骨瘤病灶，但患者自身并无不适症状。
生长缓慢阶段：内生性软骨瘤生长速度较为缓慢，在相当长的一段时间内，肿瘤与周围组织处于相对稳定的状态，没有引起明显的炎症反应或对周围神经等结构造成刺激，因此也不会产生疼痛。例如一些青少年或成年人，内生性软骨瘤长期处于稳定的生长状态，未出现疼痛表现。
疼痛情况
肿瘤增大压迫周围组织：随着内生性软骨瘤逐渐增大，可能会对周围的骨组织、神经、血管等产生压迫。如果压迫到周围的神经，就可能引起疼痛。比如压迫到邻近的感觉神经时，患者会感觉到相应部位的疼痛，这种疼痛可能为隐痛、胀痛等。在儿童中，如果内生性软骨瘤发生在长骨等部位，随着身体的生长发育，肿瘤相对增大，压迫周围组织的可能性增加，相对成人可能更早出现疼痛症状。对于女性患者，如果内生性软骨瘤发生在骨盆等部位，妊娠、分娩等生理过程可能会对肿瘤产生一定影响，若肿瘤压迫周围组织，也可能诱发或加重疼痛。
发生病理性骨折时：内生性软骨瘤患者的骨组织由于肿瘤的存在变得脆弱，当受到轻微外力时就可能发生病理性骨折。骨折发生时会引起剧烈的疼痛，同时还可能伴有局部的肿胀、畸形、活动受限等表现。无论是儿童还是成人，发生病理性骨折时疼痛都较为明显，儿童可能因为表述不清而表现为哭闹、局部肢体不敢活动等，而成人则能明确感觉到骨折部位的剧烈疼痛。例如，一个患有内生性软骨瘤的青少年，在日常活动中不小心摔倒，就可能引发病理性骨折，出现受伤部位的剧烈疼痛。
内生性软骨瘤是否疼痛与肿瘤的大小、生长速度、是否发生病理性骨折等多种因素有关。如果发现骨内有异常病灶，怀疑内生性软骨瘤，应及时进行进一步检查，如X线、CT、磁共振成像（MRI）等，以明确病情，并根据具体情况采取相应的处理措施。
