低位肛瘘瘘管位于外括约肌深部以下，症状为疼痛较轻、分泌物少量，肛门指检可摸到皮下条索状瘘管，探针易顺利探入，造影可见瘘管短且局限；高位肛瘘瘘管位于外括约肌深部以上，症状为疼痛较复杂严重、分泌物较多，肛门指检直肠内可摸到瘘管走向但不清晰，探针探查不易顺利通过，造影可见瘘管走行复杂、分支多且延伸至直肠环以上。
一、解剖位置鉴别
（一）低位肛瘘
低位肛瘘是指瘘管位于外括约肌深部以下。可分为低位单纯性肛瘘和低位复杂性肛瘘。低位单纯性肛瘘只有一个瘘管且累及肛门周围皮下组织；低位复杂性肛瘘有多个瘘管和支管，但其范围局限于肛门直肠环以下。
（二）高位肛瘘
高位肛瘘是瘘管位于外括约肌深部以上。高位单纯性肛瘘仅有一个瘘管，瘘管穿过外括约肌深部以上；高位复杂性肛瘘有多个瘘管和支管，病变范围涉及肛门直肠环以上。
二、症状表现鉴别
（一）低位肛瘘
1.疼痛：低位肛瘘的疼痛相对较轻，常表现为局部的坠胀感或隐痛，在排便时由于粪便刺激瘘管，疼痛可能会稍有加重，但一般不会出现剧烈的、难以忍受的疼痛。这是因为其病变位置较浅，受肛门括约肌的影响相对较小。
2.分泌物：肛门周围可出现少量的脓性或黏液性分泌物，由于瘘管位置低，分泌物容易从外口流出，污染内裤。
（二）高位肛瘘
1.疼痛：高位肛瘘的疼痛相对较为复杂和严重，由于瘘管位置高，病变涉及肛门直肠环以上，括约肌的功能受到影响更大，疼痛可能较为剧烈，且疼痛的性质可能更复杂，可能会出现放射性疼痛等情况。
2.分泌物：高位肛瘘的分泌物可能较多，因为病变范围广，瘘管分支多，分泌物容易从多个外口流出，而且分泌物的性状可能更浓稠，有时还可能伴有粪便等物质排出，这是因为高位肛瘘与直肠腔相通的可能性相对更高。
三、检查方法鉴别
（一）肛门指检
1.低位肛瘘：肛门指检时可在肛门周围皮下摸到条索状的瘘管，按压时有明显的压痛，且能感觉到瘘管与肛门括约肌的关系，一般瘘管位于外括约肌深部以下，通过指检可以较为清晰地触及到病变的范围。
2.高位肛瘘：肛门指检时在直肠内可摸到条索状的瘘管走向，但由于位置较高，瘘管通常位于外括约肌深部以上，手指触摸时可能不如低位肛瘘那样清晰地触及到瘘管的全程，需要结合其他检查方法进一步明确。
（二）探针检查
1.低位肛瘘：用探针探查时，探针容易从外口顺利地探入瘘管，并可从内口穿出，瘘管走行相对直，容易操作。
2.高位肛瘘：探针探查时，由于瘘管位置高，走行复杂，探针不容易顺利通过瘘管，而且可能会出现弯曲、受阻等情况，需要借助其他方法如染色等辅助检查来明确瘘管的走行。
（三）造影检查
1.低位肛瘘：经外口注入造影剂后，X线造影可见瘘管较短，局限于肛门周围皮下，造影剂能较为清晰地显示出瘘管的形态和范围。
2.高位肛瘘：经外口注入造影剂后，X线造影可见瘘管走行复杂，有多个分支，且瘘管延伸至肛门直肠环以上，造影剂分布范围广，能更清楚地显示出高位肛瘘病变的复杂程度和广泛范围。
