直肠脱垂有多种症状表现，初期排便时直肠黏膜脱出可自行回纳，后期直肠全层脱出需手推回或卧床休息回纳；局部有刺激症状，如瘙痒、潮湿、疼痛（脱出嵌顿坏死时剧痛）；排便会异常，有便秘、腹泻、里急后重；还可能有出血（量少或较多）及全身症状（严重者消瘦、乏力等，儿童可致生长发育迟缓，成年人影响工作生活）。
初期：排便时直肠黏膜脱出，便后可自行回纳。多见于儿童，通常是在排便过程中，可见直肠黏膜呈红色、表面光滑的肿物从肛门脱出，长度一般较短，可能仅有几厘米。对于儿童来说，由于其身体各器官发育尚不完善，肛门括约肌功能相对较弱，在腹压增加（如排便用力）时容易出现直肠黏膜脱出。
后期：直肠全层脱出，甚至咳嗽、行走、下蹲时也可脱出，需用手推回或卧床休息后才能回纳。随着病情进展，成年人直肠脱垂情况可能逐渐加重，脱出的直肠组织会增多，长度变长，此时对日常生活影响较大，比如在日常活动中稍不注意腹压增加就会导致直肠脱出，且回纳相对困难。
局部刺激症状
瘙痒：脱出的直肠黏膜受到刺激，分泌黏液，刺激肛周皮肤，引起瘙痒不适。尤其是儿童，因为其皮肤相对娇嫩，肛周皮肤长期受到黏液刺激，更容易出现瘙痒，可能会不断搔抓肛周，导致皮肤破损等情况。成年人也会因瘙痒影响生活质量，搔抓可能进一步损伤肛周皮肤，增加感染风险。
潮湿：直肠黏膜反复脱出，导致黏液不断渗出，使肛周皮肤处于潮湿状态。这不仅会引起瘙痒，还可能继发皮疹等皮肤问题。儿童长期肛周潮湿，可能影响其臀部皮肤健康，而成年人则会因肛周潮湿带来诸多不便，比如衣物与肛周皮肤的摩擦增加等。
疼痛：当直肠脱出后未能及时回纳，发生嵌顿、缺血、坏死时，会出现剧烈疼痛。这种疼痛较为严重，儿童可能会表现出哭闹不安、拒绝排便等情况，成年人则会感到肛门部剧烈疼痛，坐立不安，严重影响正常的生活和行动。例如，直肠脱垂嵌顿后，局部组织缺血缺氧，会引发强烈的疼痛反应，需要及时就医处理。
排便异常
便秘：部分直肠脱垂患者可伴有便秘，这是因为直肠黏膜脱出刺激肛门，导致患者惧怕排便，从而引起排便困难，粪便在肠道内停留时间过长，水分被过度吸收，进一步加重便秘。儿童可能会因为害怕排便时的不适而有意减少排便次数，导致便秘；成年人也可能因为心理因素和直肠局部的病理改变而出现便秘症状，长期便秘又会加重直肠脱垂的病情，形成恶性循环。
腹泻：直肠脱垂可影响直肠的正常功能，导致肠道蠕动功能紊乱，出现腹泻症状。儿童由于消化系统发育尚未成熟，直肠脱垂后更容易出现肠道功能紊乱，引发腹泻；成年人则可能因为直肠脱垂导致的直肠局部炎症等因素，出现腹泻情况，影响日常生活和营养吸收。
里急后重：感觉肛门坠胀，有排便不尽感。这是由于直肠黏膜脱出刺激直肠末端神经所致。儿童可能会表现出频繁想要排便但又排不出多少的情况；成年人则会明显感到肛门部位的异常坠胀感，影响其工作和生活状态。
其他症状
出血：一般出血量较少，表现为粪便表面带血或便后手纸上有鲜血。但如果直肠黏膜长期脱出，受到摩擦，也可能出现较多量的出血。儿童由于活动相对较频繁，直肠黏膜脱出后摩擦的机会较多，可能更容易出现少量出血；成年人若直肠脱垂情况较严重，也可能出现出血症状，长期慢性出血可能会导致贫血等并发症，尤其是老年人，本身可能存在贫血的潜在风险，直肠脱垂出血可能会加重贫血程度。
全身症状：严重的直肠脱垂患者，由于长期慢性失液、失血等，可能会出现消瘦、乏力、精神萎靡等全身症状。儿童长期直肠脱垂影响营养吸收和身体发育，可能会出现生长发育迟缓等情况；成年人则会因为全身状况的变差，影响工作能力和生活质量，需要积极治疗来改善全身状况。
