凌晨血压高可能由肾素-血管紧张素系统激活、交感神经活性增强、皮质醇分泌高峰影响、血液黏稠度变化及药物作用时间不足等因素导致，肾素-血管紧张素系统激活使血管紧张素Ⅱ生成增多致外周血管阻力增加；交感神经活性增强释放神经递质使心率加快、血管收缩；皮质醇分泌高峰促进相关反应致血压升高；血液黏稠度升高使血流阻力增大；降压药物作用时间不足不能有效控制凌晨血压。
交感神经活性增强
在凌晨时，人体的交感神经活性会显著增强。交感神经兴奋会释放去甲肾上腺素等神经递质，这些神经递质会作用于心脏和血管，使心率加快、心肌收缩力增强，同时促使血管收缩，最终导致血压升高。比如一些长期熬夜、生活作息不规律的人群，其交感神经的昼夜节律可能被打乱，更容易出现凌晨血压高的状况；而对于患有高血压的老年人群，本身自主神经调节功能就有所减退，交感神经活性的异常波动更易引发凌晨血压升高。
皮质醇分泌高峰影响
人体的皮质醇分泌具有明显的昼夜节律，通常在凌晨2-3点开始升高，早上6-8点达到高峰。皮质醇是一种应激激素，它可以促进肝糖原分解、升高血糖，还能增强血管对去甲肾上腺素等缩血管物质的敏感性，从而导致血压升高。对于患有皮质醇增多症等内分泌疾病的患者，皮质醇的分泌节律可能紊乱，会更容易出现凌晨血压高的情况；而对于正常人群，如果近期精神压力过大，也可能影响皮质醇的正常分泌节律，进而导致凌晨血压波动升高。
血液黏稠度变化
夜间人体处于相对静止状态，水分摄入相对减少，同时肾脏的浓缩功能会使尿液生成减少，这会导致血液黏稠度逐渐升高。血液黏稠度升高会使血流阻力增大，心脏需要更大的力量来推动血液流动，从而引起血压升高。对于一些本身存在血液高凝状态的人群，或者是老年人，由于其血管弹性下降，凌晨时血液黏稠度的升高更容易导致血压升高；而如果在睡前大量饮酒、喝咖啡等，也可能影响夜间的血液黏稠度，增加凌晨血压高的风险。
药物作用时间不足
对于正在服用降压药物的患者，如果所服用的降压药物的作用时间不能覆盖整个夜间及凌晨时段，就可能出现凌晨血压高的情况。例如一些中短效的降压药物，其药效持续时间较短，不能很好地控制凌晨时段的血压；而对于服用长效降压药物的患者，如果药物的个体代谢差异等因素，也可能导致凌晨时段药物浓度下降，无法有效控制血压。
