花椒水有抑菌抗炎、缓解牙痛、温中散寒、驱虫等作用，但抑菌抗炎时严重细菌感染不能仅靠它，缓解牙痛只是临时措施，温中散寒需结合病情综合处理，驱虫不能自行仅用它，儿童使用要谨慎且有相关情况需就医规范处理。
花椒中含有挥发油等成分，具有一定的抑菌抗炎功效。例如研究发现花椒水对常见的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等有一定的抑制作用。这是因为其挥发油中的有效成分能够干扰细菌的生长繁殖过程，对于一些由细菌引起的轻度皮肤感染等情况，在一定程度上可能起到辅助抑制细菌的作用，但如果是严重的细菌感染性疾病，不能仅依靠花椒水来治疗，还是需要就医进行规范的抗菌治疗。对于儿童来说，如果有皮肤的轻度感染，在家长的监护下可以尝试用花椒水清洗，但要注意观察皮肤反应，若出现过敏等不适要立即停止使用。
缓解牙痛
当出现轻度牙痛时，用花椒水含漱可能会有一定的缓解作用。花椒中的某些成分有局部麻醉样的效果，能暂时减轻牙痛症状。不过这只是临时的缓解措施，不能从根本上解决牙痛的病因。比如龋齿、牙髓炎等引起的牙痛，花椒水只能起到短暂止痛的作用，还是需要及时到口腔科进行针对性治疗。对于儿童牙痛，家长要谨慎使用花椒水含漱，因为儿童可能不会很好地控制含漱的时间和方式，而且儿童牙痛的原因较为复杂，最好带儿童到儿科或口腔科就诊明确病因后再进行合适的处理。
温中散寒
从中医角度来讲，花椒水有温中散寒的功效，对于脾胃虚寒引起的脘腹冷痛、呕吐泄泻等有一定的调理作用。但在现代医学中，对于这种情况不能单纯依靠花椒水来治疗，而是需要结合具体病情进行综合处理。比如一些因脾胃虚寒导致消化不良、经常腹痛腹泻的人群，可以在医生的指导下适当配合一些温和调理脾胃的方法，但不能完全依赖花椒水。对于特殊人群如老年人，本身脾胃功能可能相对较弱，如果存在脾胃虚寒相关症状，在考虑使用花椒水辅助调理时，要注意适量，避免过量饮用导致胃肠道不适等情况。
驱虫作用
花椒水在一定程度上有驱虫的效果，传统上常用于驱蛔虫等。不过现代医学对于驱虫有更规范的药物和方法。如果怀疑有肠道寄生虫感染，不能自行仅用花椒水来驱虫，应该到医院进行相关检查，明确寄生虫种类后选择合适的驱虫药物进行治疗。对于儿童来说，肠道寄生虫感染较为常见，家长要注意儿童的个人卫生，预防寄生虫感染，若怀疑有寄生虫感染，要在医生的指导下进行规范处理，而不是自行用花椒水驱虫。
