小儿鼻窦炎病因复杂，包括感染因素（病毒感染致鼻窦窦口黏膜肿胀、继发细菌感染引发化脓性炎症）、解剖因素（鼻窦发育未成熟、通道狭窄致窦口阻塞）、过敏因素（过敏性鼻炎致鼻黏膜水肿、窦口阻塞）、免疫因素（免疫系统发育未成熟、抵抗力弱）及其他因素（空气污染刺激鼻黏膜、不良生活习惯致鼻窦感染）。
感染因素
病毒感染：上呼吸道病毒感染是小儿鼻窦炎常见的起始因素，例如鼻病毒、流感病毒等。病毒感染可引起鼻腔和鼻窦黏膜的炎症反应，导致鼻窦窦口黏膜肿胀，影响鼻窦的引流。儿童的免疫系统尚不完善，更容易受到病毒的侵袭，据相关研究表明，多数小儿鼻窦炎早期往往有病毒感染的前驱表现。
细菌感染：在病毒感染的基础上容易继发细菌感染，常见的致病菌有肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等。当鼻窦引流不畅时，细菌在鼻窦内滋生繁殖，引发化脓性炎症。儿童的鼻窦解剖结构特点使得鼻窦窦口相对较宽，鼻黏膜柔嫩，血管丰富，一旦感染，炎症容易扩散。
解剖因素
儿童鼻窦发育尚未成熟，鼻窦腔相对较小，鼻窦黏膜娇嫩，血管丰富，一旦发生感染，容易引起黏膜肿胀，导致窦口阻塞，影响鼻窦的通气和引流。例如，上颌窦在2-3岁时开始发育，筛窦出生后就已存在，但要到12-13岁才发育完善，这些未发育成熟的鼻窦更容易发生炎症。
鼻腔与鼻窦的通道狭窄，鼻道内的淋巴组织丰富，儿童时期淋巴组织较为活跃，容易增生肥大，进一步阻塞鼻窦的通气引流通道，增加鼻窦炎的发病风险。
过敏因素
过敏性鼻炎是小儿鼻窦炎的重要诱因之一。过敏体质的儿童接触过敏原后，如花粉、尘螨、动物毛发等，鼻黏膜发生变态反应性炎症，导致鼻黏膜水肿，窦口阻塞，影响鼻窦分泌物的排出，从而引发鼻窦炎。研究发现，约有40%的小儿鼻窦炎与过敏性鼻炎相关，过敏体质的儿童在花粉季节等过敏原暴露时，鼻窦炎的发病几率明显升高。
免疫因素
儿童免疫系统发育尚未成熟，免疫功能相对低下，对病原体的抵抗力较弱，容易发生感染性疾病，包括鼻窦炎。例如，婴幼儿的IgG、IgA等免疫球蛋白水平相对较低，黏膜免疫功能不完善，使得鼻腔和鼻窦更容易受到病原体的侵袭。随着年龄的增长，免疫功能逐渐完善，小儿鼻窦炎的发病率会相对降低，但在儿童时期尤其是婴幼儿阶段，免疫因素仍是重要的发病基础。
其他因素
环境因素：空气污染严重的环境中，空气中的颗粒物、有害气体等会刺激儿童的鼻黏膜，损伤鼻黏膜的防御功能，增加鼻窦炎的发病几率。例如，长期生活在雾霾天气较多的地区，儿童患鼻窦炎的风险会明显增加。
不良生活习惯：如游泳时呛水，污水容易进入鼻窦引发感染；鼻腔异物长期存留也可导致鼻窦感染，儿童好奇心强，容易将异物塞入鼻腔，若未及时取出，就可能引起鼻窦炎症。
