自身免疫性胰腺炎的检查包括血液学、影像学及病理学检查。血液学检查可见血清γ-球蛋白、IgG及其亚型尤其是IgG4升高，部分有炎症指标异常；影像学检查中腹部超声可初步筛查，CT有典型表现，MRI及MRCP能清晰显示胰管改变；病理学检查通过胰腺活检可见特定特征。特殊人群检查需注意相关问题。
其他血液指标：部分患者可能有红细胞沉降率（ESR）增快、C反应蛋白（CRP）升高等炎症指标异常，但这些指标并非自身免疫性胰腺炎特异性的，其他炎症性疾病也可能出现类似改变。
影像学检查
腹部超声：可发现胰腺肿大等表现，但超声对胰腺病变的细节显示不如CT等检查，不过对于初步筛查胰腺有无异常有一定帮助。例如，可观察到胰腺弥漫性或局限性肿大等情况。
计算机断层扫描（CT）：典型表现为胰腺弥漫性或节段性肿大，边缘呈“腊肠样”改变，增强扫描可见“双轨征”，即胰腺实质强化程度低于周围正常组织，胰管周围强化相对明显。CT能够较清晰地显示胰腺的形态、大小及周围组织情况，有助于诊断自身免疫性胰腺炎。多项临床研究显示，CT对自身免疫性胰腺炎的诊断有较高的价值。
磁共振成像（MRI）及磁共振胰胆管造影（MRCP）：MRI对于胰腺病变的软组织分辨力更高，MRCP可以清晰显示胰管的形态，自身免疫性胰腺炎患者常表现为胰管不规则狭窄、扩张等改变，如胰管呈串珠样改变等。在一些不典型病例的诊断中，MRI和MRCP能提供更丰富的信息。
病理学检查
胰腺活检：经内镜逆行胰胆管造影（ERCP）引导下的胰腺活检或经皮胰腺穿刺活检是获取病理学证据的重要方法。自身免疫性胰腺炎的病理学特征主要包括大量淋巴细胞、浆细胞浸润，尤其是IgG4阳性浆细胞的浸润，以及胰腺导管周围纤维化等。通过病理学检查可以明确诊断，并且与其他胰腺疾病如胰腺癌等进行鉴别诊断。对于一些临床高度怀疑自身免疫性胰腺炎但影像学等表现不典型的患者，胰腺活检尤为重要。
特殊人群方面，儿童自身免疫性胰腺炎相对少见，但诊断时同样需要进行上述检查项目，在进行影像学检查时要注意辐射剂量等问题；对于老年患者，要考虑其可能合并其他基础疾病对检查结果的影响，例如老年患者可能有肾功能不全等情况，在使用造影剂等检查时需谨慎评估；对于有药物过敏史等特殊情况的患者，在选择检查方法和药物（如造影剂等）时要充分考虑过敏风险，提前做好相应的预防和应对措施。
