新生儿寒冷损伤综合征病因包括寒冷和保温不足（寒冷环境、保温不当致散热多）、体温调节中枢发育不成熟（早产儿中枢更不完善、棕色脂肪少产热弱）、能源物质储存不足产热不足（棕色脂肪少、能量摄入不足）、疾病影响（感染性疾病干扰代谢体温调节、先天性畸形致功能异常影响代谢体温调节）。
一、寒冷和保温不足
寒冷环境因素：新生儿尤其是早产儿，体温调节中枢发育不成熟，其皮下脂肪薄，皮肤表面积相对较大，容易散热。当处于寒冷环境中，如寒冷季节、室内温度过低、新生儿暴露在冷空气中时间过长等，机体散热增加，若产热不足以代偿散热，就会导致体温降低，引发寒冷损伤综合征。例如，在冬季户外暴露的新生儿，很容易因寒冷而出现体温下降及相关症状。
保温措施不当：新生儿出生后如果没有采取有效的保温措施，比如没有及时包裹温暖的襁褓、没有使用暖箱等，也会使新生儿散失过多热量，增加患病风险。早产儿体温调节能力更差，对保温的要求更高，若保温不当，发生寒冷损伤综合征的几率会显著增加。
二、体温调节中枢发育不成熟
新生儿的体温调节中枢尚不完善，对体温的调节能力较弱。早产儿的体温调节中枢发育比足月儿更不成熟，其产热主要依靠棕色脂肪，而棕色脂肪储存量少，产热能力有限。当遇到寒冷刺激时，早产儿不能有效地通过自身调节来维持体温恒定，容易出现体温降低，进而引发寒冷损伤综合征。
三、能源物质储存不足，产热不足
棕色脂肪少：新生儿，尤其是早产儿体内棕色脂肪含量较少。棕色脂肪是新生儿产热的重要能源，在寒冷时，棕色脂肪细胞内的脂质分解产热。早产儿棕色脂肪储存量不足，产热能力弱，在寒冷环境下更易出现体温不升，导致寒冷损伤综合征。
能量摄入不足：新生儿出生后如果喂养不及时，能量摄入不足，身体的能量储备不能满足寒冷环境下的产热需求，也会影响体温的维持，增加患病可能性。例如，一些早产儿可能因吸吮、吞咽能力较弱，导致奶量摄入不足，从而影响产热。
四、疾病影响
感染性疾病：新生儿感染败血症、肺炎等感染性疾病时，机体的代谢率会发生变化，可能导致产热减少。同时，感染还会影响新生儿的体温调节功能，使其更容易受到寒冷的影响。例如，新生儿败血症时，细菌产生的毒素可能干扰体温调节中枢的功能，使新生儿体温难以维持正常，增加寒冷损伤综合征的发生风险。
先天性畸形：某些先天性畸形的新生儿，如先天性心脏病等，可能存在机体功能的异常，影响其正常的代谢和体温调节。这些新生儿在寒冷环境下更易出现体温降低，引发寒冷损伤综合征。例如，先天性心脏病导致心功能不全的新生儿，其身体的血液循环和代谢可能受到影响，产热能力下降。
