卵泡囊肿形成涉及多种因素，包括正常卵泡发育异常（生理情况下卵泡未正常闭锁持续生长）、内分泌紊乱（垂体功能异常致FSH和LH分泌失调、卵巢自身内分泌失调）、其他因素（局部炎症影响卵巢功能、药物影响干扰内分泌平衡致卵泡发育异常）。
正常卵泡发育异常
生理情况下：女性正常的卵泡发育过程中，卵泡会经历募集、选择和优势化等阶段。在优势卵泡形成后，其他卵泡会逐渐闭锁。但如果卵泡没有正常闭锁，持续生长，就可能形成卵泡囊肿。例如，在正常月经周期中，优势卵泡成熟并排卵后，卵泡壁会塌陷，形成黄体。但如果卵泡未排卵，继续增大，直径超过1-2厘米时，就可能成为卵泡囊肿。这种情况在各个年龄段有正常月经周期的女性中都可能发生，与自身的内分泌调节有一定关系，因为内分泌系统中的激素水平变化，如促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）的分泌失衡等，可能影响卵泡的正常发育和闭锁过程。
内分泌紊乱
垂体功能异常：垂体分泌的FSH和LH对卵泡的发育起重要调节作用。当垂体出现病变，如垂体瘤等，可能导致FSH和LH的分泌量或比例失调。例如，垂体瘤可能会使FSH分泌减少，影响卵泡的正常成熟及排卵，进而导致卵泡持续生长形成囊肿。这种情况在有垂体相关疾病史的女性中更易发生，不同年龄的女性都可能受垂体功能异常影响，如育龄期女性可能因垂体瘤等疾病出现卵泡囊肿。
卵巢自身内分泌失调：卵巢自身的内分泌功能紊乱也可引发卵泡囊肿。例如，卵巢颗粒细胞功能异常，可能影响雌激素的分泌及对卵泡发育的反馈调节。雌激素分泌异常会干扰卵泡正常的生长、发育和排卵过程，使得卵泡不能正常闭锁而持续增大形成囊肿。这种情况在有卵巢疾病史或者内分泌代谢异常的女性中较为常见，如患有多囊卵巢综合征的女性，其卵巢内往往存在多个小卵泡发育，但难以正常排卵，容易形成卵泡囊肿，多囊卵巢综合征常见于育龄期女性。
其他因素
局部炎症：盆腔的局部炎症可能影响卵巢的正常功能，进而影响卵泡的发育。例如，盆腔炎等炎症性疾病，炎症因子可能刺激卵巢组织，导致卵泡发育异常，不能正常闭锁而形成囊肿。这种情况在有盆腔炎症病史的女性中发生风险相对较高，各个年龄段有盆腔炎症的女性都可能出现这种情况，如性活跃期的女性由于性生活等因素容易发生盆腔炎症，进而增加卵泡囊肿的形成风险。
药物影响：某些药物的使用可能会干扰体内的内分泌平衡，从而影响卵泡的发育。例如，长期使用某些促排卵药物，如果使用不当，可能打破正常的卵泡发育和排卵规律，导致卵泡持续生长形成囊肿。这种情况在有促排卵治疗史的女性中需要关注，不同年龄接受促排卵治疗的女性都可能面临因药物使用不当导致卵泡囊肿的风险，如因不孕症接受促排卵治疗的育龄期女性。
