自身免疫性胰腺炎的诊断需从临床表现评估、实验室检查、影像学检查、组织病理学检查及鉴别诊断等方面进行。临床表现有消瘦、乏力等全身表现及腹痛、黄疸等消化系统表现；实验室检查可见血清淀粉酶和脂肪酶多正常或轻度升高，约半数患者有自身抗体升高，出现黄疸时肝功能指标异常；影像学检查中腹部超声可发现胰腺肿大等，CT有胰腺弥漫性或局限性肿大等典型表现，MRI及MRCP能更清晰显示胰胆管等；组织病理学检查是金标准，可见特定细胞浸润等改变；需与胰腺癌、慢性胰腺炎等鉴别，胰腺癌有不同血清标志物及影像学表现，慢性胰腺炎有特定病史及表现。
一、临床表现评估
一般情况：自身免疫性胰腺炎患者可能有消瘦、乏力等非特异性全身表现，不同年龄、性别患者表现可能有差异，例如老年患者可能基础疾病较多，会影响对自身免疫性胰腺炎症状的感知；女性患者在激素变化等因素下，症状可能不典型。生活方式方面，长期吸烟、饮酒等可能影响胰腺状态，但自身免疫性胰腺炎主要与自身免疫机制相关，生活方式更多是辅助因素。有自身免疫性疾病病史的患者，发生自身免疫性胰腺炎的风险相对较高。
消化系统表现：常见有腹痛，多为上腹部隐痛或胀痛，疼痛程度不一；部分患者有黄疸，是由于胰头部病变压迫胆管导致胆汁排出受阻引起，不同年龄患者黄疸出现时的表现可能不同，儿童黄疸可能伴有生长发育受影响等情况，成人则可能影响日常活动。
二、实验室检查
血清学指标
血清淀粉酶和脂肪酶：多数患者血清淀粉酶和脂肪酶可正常或轻度升高，这与经典急性胰腺炎不同，经典急性胰腺炎时血清淀粉酶和脂肪酶多显著升高，自身免疫性胰腺炎以此可进行初步鉴别。
自身抗体：约半数自身免疫性胰腺炎患者可检测到自身抗体，如IgG4水平升高具有重要意义，IgG4相关性疾病中IgG4往往明显升高，自身免疫性胰腺炎属于IgG4相关性疾病的一种，血清IgG4水平＞135mg/dL对自身免疫性胰腺炎的诊断有较高特异性和敏感性；此外，还可能检测到抗核抗体等自身抗体，但抗核抗体等特异性相对较低。
肝功能指标：出现黄疸时，肝功能指标如胆红素、碱性磷酸酶、谷氨酰转肽酶等会异常，胆红素升高以直接胆红素为主，反映胆汁排泄障碍。
三、影像学检查
腹部超声：可发现胰腺肿大，多为弥漫性肿大，也可呈局限性肿大，胰腺实质回声不均匀，胆管可能有扩张等表现，但超声对胰腺细微结构显示不如CT、MRI清晰，对于肥胖患者等超声检查可能受限。
计算机断层扫描（CT）
典型表现：胰腺弥漫性或局限性肿大，胰管呈串珠样扩张是自身免疫性胰腺炎较特征性的CT表现，增强扫描可见胰腺实质呈延迟强化，动脉期胰腺强化不明显，静脉期逐渐强化。不同年龄患者CT表现可能有一定差异，儿童患者由于胰腺发育等因素，肿大表现可能与成人有别，但基本的胰管扩张等特征可能存在。
磁共振成像（MRI）及磁共振胰胆管造影（MRCP）
优势：MRCP能更清晰显示胰胆管系统的形态，对于胰管狭窄、扩张的显示比CT更直观，胰腺实质在MRI上的信号改变也能较好显示，有助于明确胰腺病变范围及与周围组织的关系。在评估自身免疫性胰腺炎时，能提供与CT类似但更精细的图像信息，对于一些不典型病例的诊断有重要价值。
四、组织病理学检查
胰腺活检：经内镜逆行胰胆管造影（ERCP）引导下的胰腺活检或手术切除胰腺组织活检是诊断自身免疫性胰腺炎的金标准。组织学上可见胰腺间质大量淋巴细胞、浆细胞浸润，IgG4阳性浆细胞显著增多，胰腺导管上皮有损伤等改变。对于无法进行手术活检的患者，ERCP活检有一定诊断价值，但存在一定假阴性率，需要结合临床及其他检查综合判断。特殊人群如儿童进行胰腺活检时，要充分评估风险，选择合适的操作时机和方式，以减少对儿童身体的损伤。
五、鉴别诊断
与胰腺癌鉴别：胰腺癌也可表现为胰腺肿大、胆管扩张等，但其血清肿瘤标志物如CA19-9等往往显著升高，影像学上胰腺癌多有占位性病变，边界不清，与自身免疫性胰腺炎的影像学表现有差异，通过组织病理学检查可明确鉴别，自身免疫性胰腺炎组织学特征与胰腺癌截然不同。
与慢性胰腺炎鉴别：慢性胰腺炎多有长期酗酒等病史，胰腺钙化、胰管结石等是慢性胰腺炎较典型表现，而自身免疫性胰腺炎胰管扩张多为串珠样，血清IgG4等检查可帮助鉴别，慢性胰腺炎一般无IgG4显著升高。
