小儿心肌炎症状多样，与年龄、病情严重程度相关，轻症表现隐匿，典型症状有心脏相关（年长儿诉心前区不适等，婴幼儿拒食等，严重时呼吸困难、心率改变）、全身症状（多数发热，伴乏力、多汗、肌肉酸痛等）、其他系统受累表现（有的有消化道症状、皮肤黏膜改变，少数累及神经有头痛头晕等），家长需密切关注儿童表现，有病毒感染病史后出现异常要及时就医，延误诊治可致严重并发症危及生命。
轻症表现：部分患儿可能仅有轻微不适，如精神欠佳、乏力，在活动后可能会出现面色苍白、呼吸急促等情况。一般来说，这些症状相对隐匿，容易被忽视，因为患儿可能只是比平时稍微显得没那么活泼，活动耐力较之前有所下降，但这些表现缺乏特异性，容易和儿童正常的生长发育过程中的一些表现相混淆。
典型症状
心脏相关症状：年长儿可能会诉说心前区不适、心悸、胸闷等。婴幼儿则可能表现为拒食、烦躁不安、哭闹等。随着病情进展，严重时可出现呼吸困难，这是因为心脏功能受损，导致肺循环淤血，影响气体交换。还可能出现心率的改变，可表现为心率增快或减慢，心率增快较为常见，这是身体的一种代偿反应，但如果心率过快且持续不缓解，提示病情可能较为严重。
全身症状：多数患儿会有发热，体温可在38℃左右，也有部分患儿体温更高。同时还可能伴有乏力、多汗、肌肉酸痛等表现，这是因为病毒感染等因素引起的全身炎症反应，病毒及其毒素等可作用于机体，导致全身多个系统出现反应。
其他系统受累表现：有的患儿可能出现恶心、呕吐等消化道症状，这是因为病毒感染可能累及胃肠道；少数患儿可能出现皮肤黏膜的改变，如皮疹等。如果病情累及神经系统，还可能出现头痛、头晕等症状，但相对较少见。
对于小儿心肌炎，由于儿童表述能力有限等特点，家长需要密切关注儿童的日常表现，一旦发现儿童出现上述异常表现，尤其是在有病毒感染病史（如近期有感冒、腹泻等病毒感染情况）后出现上述症状，应及时带儿童就医，进行相关检查，如心电图、心肌酶谱、心脏超声等，以便早期诊断和治疗。因为小儿心肌炎如果延误诊治，可能会发展为重症心肌炎，出现心力衰竭、心律失常甚至心源性休克等严重并发症，危及患儿生命。
