普通B超能在一定程度上看出部分胎儿畸形但有局限性，孕中期系统B超可发现部分大体结构畸形和软指标异常，却受孕周、胎儿体位影响，难检出微小、功能及部分染色体相关畸形，特殊人群还需结合其他检查。
能检出的部分畸形
大体结构畸形：对于一些较为明显的大体结构畸形，普通B超有一定的检测能力。例如，胎儿的脑部畸形，像无脑儿，通过普通B超检查可以发现胎儿颅骨光环缺失；脊柱裂也能通过B超观察到脊柱的连续性中断等情况；心脏畸形方面，一些较明显的心脏结构异常，如大型的室间隔缺损等，在合适的孕周和检查条件下，普通B超也有可能检测出来；四肢畸形，如严重的肢体缺失等，普通B超可以发现胎儿肢体部分结构的异常。一般在孕中期（20-24周左右）进行的系统B超检查，是排查胎儿结构畸形的重要时期，此时胎儿的各个器官基本发育成形，通过普通B超的切面观察等，可以发现不少明显的结构异常。
部分软指标异常：普通B超还能发现一些胎儿的软指标异常，这些软指标虽然不是明确的畸形，但可能提示胎儿有染色体异常等风险。比如NT（颈项透明层）增厚，在孕早期通过普通B超测量NT厚度，若增厚超过正常范围，可能提示胎儿有唐氏综合征等染色体异常的风险。
存在的局限性
受孕周影响：在孕早期，胎儿各个器官刚刚开始发育，结构还比较细小，普通B超可能无法清晰分辨所有结构，对于一些微小的畸形可能检测不出来。而到了孕晚期，胎儿较大，子宫内空间相对狭窄，胎儿的一些结构可能被遮挡，也会影响畸形的检出率。
受胎儿体位影响：如果胎儿的体位不合适，某些部位被遮挡，就可能导致无法全面观察胎儿的结构，从而遗漏一些畸形。例如胎儿背部朝向检查者时，脊柱的检查可能会受到影响。
某些畸形难以检出：对于一些微小的染色体微缺失微重复相关的畸形，普通B超无法检测到；一些功能方面的畸形，如智力发育相关的畸形等，普通B超也不能直接检测出来。
对于特殊人群，比如有家族遗传病史的孕妇，普通B超检测胎儿畸形的同时，还需要结合其他检查手段，如唐筛、无创DNA检测甚至羊水穿刺等进一步明确胎儿情况；对于高龄孕妇，普通B超检出畸形后可能需要更精准的检查来确定胎儿具体情况。
