肾盂肾炎的发生与致病菌感染、机体因素、医源性因素有关。主要致病菌是大肠杆菌等，感染途径有上行和血行；机体因素包括尿路梗阻、免疫力低下、尿道结构或功能异常；医源性因素有导尿等操作及尿路结石碎石术后。
一、致病菌感染
（一）主要致病菌
大肠杆菌是引起肾盂肾炎最常见的致病菌，约占尿路感染致病菌的80%。其他常见致病菌还包括变形杆菌、克雷伯菌属等。这些细菌可通过上行感染、血行感染等途径侵入肾盂引发炎症。例如，女性由于尿道短而直，大肠杆菌更容易从尿道上行至膀胱，进而沿输尿管蔓延至肾盂引起感染。
（二）感染途径
1.上行感染：这是最主要的感染途径。病原菌由尿道进入膀胱，然后沿输尿管向上蔓延至肾脏，导致肾盂、肾实质感染。女性的尿道较短且靠近肛门，大便中的细菌容易污染尿道，从而增加上行感染的机会。比如，不注意会阴清洁卫生时，大肠杆菌等致病菌就容易经尿道上行引发肾盂肾炎。
2.血行感染：病原菌通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。这种情况相对较少见，多发生于机体免疫力极度低下或有严重感染灶的患者。例如，皮肤感染、疖肿、扁桃体炎等病灶中的细菌，可通过血液循环播散到肾脏，引起肾盂肾炎。
二、机体因素
（一）尿路梗阻
尿路结石、前列腺增生、先天性尿路畸形等因素可引起尿路梗阻，导致尿液排出不畅。尿液潴留会使细菌容易在局部繁殖，且尿液反流可能将细菌带到肾脏，从而增加肾盂肾炎的发病风险。例如，尿路结石引起的梗阻，会使尿液在肾盂内积聚，为细菌生长提供了良好的环境，进而引发感染。
（二）机体免疫力低下
当机体免疫力下降时，如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的患者、艾滋病患者等，身体对细菌的抵御能力减弱，更容易遭受病原菌的侵袭而发生肾盂肾炎。以糖尿病患者为例，其高血糖环境有利于细菌生长，且机体的免疫功能也会受到影响，使得肾脏对细菌感染的抵抗力降低，容易患上肾盂肾炎。
（三）尿道结构或功能异常
女性的尿道短、宽，且开口靠近阴道口和肛门，这使得尿道更容易受到周围细菌的污染。此外，绝经后的女性雌激素水平降低，尿道黏膜变薄，局部抵抗力下降，也容易发生肾盂肾炎。例如，绝经后女性由于尿道黏膜萎缩，防御能力减弱，更容易出现尿路感染，进而发展为肾盂肾炎。
三、医源性因素
（一）导尿或泌尿道器械检查
进行导尿、膀胱镜检查、输尿管插管等医源性操作时，如果操作过程中没有严格遵守无菌原则，就可能将细菌带入泌尿系统，引起肾盂肾炎。比如，导尿时消毒不彻底，细菌就有可能通过导尿管进入膀胱，再上行至肾盂导致感染。
（二）尿路结石碎石术后
尿路结石患者进行体外冲击波碎石或经尿道输尿管镜碎石术后，尿路黏膜可能会受到损伤，为细菌的侵入提供了途径，从而增加了肾盂肾炎的发生几率。例如，碎石术后尿路黏膜的损伤面容易成为细菌定植的部位，若患者抵抗力下降，就容易引发肾盂肾炎。
