带状疱疹后遗神经痛的病因包括神经损伤方面（神经节内病毒持续存在致神经纤维受损、神经结构改变）、机体免疫与炎症因素（免疫炎症反应持续、免疫功能异常）、年龄因素（老年人因神经和免疫衰退易发生，儿童相对少见）、个体生活方式与基础病史因素（生活方式不良、基础病史影响）。
神经节内病毒持续存在：带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒引起，病毒会潜伏在脊髓后根神经节或颅神经感觉神经节内。在初次感染水痘-带状疱疹病毒后，病毒长期潜伏，当机体免疫力下降等诱因作用下，病毒被再次激活，沿着神经纤维移动到皮肤引起带状疱疹。而在带状疱疹发病及恢复过程中，病毒可能会对神经节内的神经细胞造成持续损伤，导致神经纤维发生炎症、变性等改变，这是引发后遗神经痛的重要原因之一。例如，研究发现病毒相关的免疫反应会持续影响神经组织，导致神经病理性损伤，进而引发疼痛。
神经结构改变：受累神经发生脱髓鞘改变，髓鞘对于神经冲动的传导起着重要作用，脱髓鞘会使神经冲动传导异常，导致疼痛信号的异常传递。同时，神经纤维可能出现轴突萎缩等结构变化，影响神经的正常功能，使得疼痛感知异常，从而产生后遗神经痛。一些电生理研究也证实了带状疱疹患者在恢复后存在神经传导速度减慢等神经结构和功能改变的情况，与后遗神经痛的发生相关。
机体免疫与炎症因素
免疫炎症反应持续：带状疱疹发病时，机体的免疫细胞会被激活，释放大量炎症介质，如前列腺素、细胞因子等。这些炎症介质会刺激神经末梢，导致疼痛产生。在带状疱疹恢复后，炎症反应可能并不会立即完全消退，持续的炎症状态会持续刺激神经，引发后遗神经痛。例如，白细胞介素-1、白细胞介素-6等细胞因子在带状疱疹后遗神经痛的发生发展中起着重要的调节作用，它们会持续影响神经组织，导致疼痛的慢性化。
免疫功能异常：患者在患带状疱疹后，机体的免疫功能可能会出现一定程度的紊乱。对于一些免疫力原本就较低的人群，如老年人，免疫功能衰退，在带状疱疹病毒激活后，机体清除病毒的能力下降，病毒持续感染神经组织的时间延长，从而更容易发生后遗神经痛。而且，免疫功能异常还可能导致神经修复过程受阻，使得神经痛难以缓解。
年龄因素
老年人更易发生：随着年龄的增长，人体的神经结构和功能会逐渐衰退，免疫系统也会逐渐老化。老年人的神经纤维本身就存在一定程度的退变，对于病毒感染等损伤的修复能力下降。同时，老年人的免疫功能减退，对水痘-带状疱疹病毒的清除能力较弱，病毒更容易在神经节内持续存在并造成损伤，所以老年人发生带状疱疹后遗神经痛的发生率明显高于年轻人。例如，流行病学调查显示，60岁以上的带状疱疹患者中，发生后遗神经痛的比例显著高于40岁以下的患者。
儿童相对少见：儿童感染水痘-带状疱疹病毒后发生带状疱疹的概率相对较低，而且即使发生带状疱疹，由于儿童的神经修复能力相对较强，免疫系统在儿童时期处于较为活跃的状态，对病毒的清除和神经损伤的修复能力较好，所以儿童发生带状疱疹后遗神经痛的情况相对少见。但也有个别免疫力低下的儿童可能会出现后遗神经痛的情况，但总体发生率远低于老年人。
个体生活方式与基础病史因素
生活方式不良：长期吸烟、酗酒的人群，其机体的免疫力会受到影响，不利于病毒感染后的恢复，增加了发生带状疱疹后遗神经痛的风险。吸烟会影响血管收缩舒张功能，导致神经组织的血液供应受到一定影响，不利于神经的修复；酗酒会损害肝脏等器官，进而影响整体的免疫功能。另外，长期精神压力大的人群，机体的应激反应会影响神经内分泌系统，导致免疫功能紊乱，也可能增加带状疱疹后遗神经痛的发生几率。例如，长期处于高压力状态下的人群，体内的皮质醇等应激激素水平升高，会抑制免疫细胞的功能，使得病毒更容易在体内持续存在并损伤神经。
基础病史影响：患有糖尿病等基础疾病的人群，由于高血糖环境有利于病毒的繁殖，且糖尿病患者往往存在神经病变等并发症，本身神经就处于一种相对敏感和易损伤的状态。当发生带状疱疹时，病毒更容易对神经造成严重损伤，并且糖尿病患者的血液循环可能存在障碍，影响神经的营养供应和修复，从而使得带状疱疹后遗神经痛的发生风险增加。例如，糖尿病患者合并带状疱疹后，后遗神经痛的发生率明显高于非糖尿病患者，其原因与糖尿病导致的神经和血管病变密切相关。
