水痘由水痘-带状疱疹病毒引起，手足口病主要由肠道病毒引起，二者在病原体、临床表现（皮疹特点、全身症状）、发病年龄、流行病学（传播途径、流行季节）、预后等方面有不同，婴幼儿感染易重症，孕妇感染水痘可影响胎儿。
临床表现方面
皮疹特点：
水痘的皮疹首先出现在躯干和头部，然后逐渐蔓延至面部、四肢，呈向心性分布。皮疹最初为红色斑疹，数小时后变为丘疹并发展成疱疹，疱疹呈椭圆形，疱壁薄易破，周围有红晕，疱液先透明后变混浊，疱疹持续3-4天，然后从中心开始干结、结痂，痂盖脱落后一般不留瘢痕。
手足口病的皮疹主要出现在手、足、口、臀等部位。初期为红色斑丘疹，很快发展为疱疹，疱疹大小如米粒至豌豆样，圆形或椭圆形，疱壁较厚，内容物澄清，周围有红晕，不疼、不痒、不结痂。
全身症状：
水痘患者全身症状相对较轻，部分患者可有低热或中度发热，伴有头痛、乏力、食欲减退等全身症状。
手足口病患者部分也有发热症状，但有些患者可能仅有皮疹而无发热，少数重症手足口病患者可出现精神差、嗜睡、易惊、头痛、呕吐等神经系统症状，以及呼吸急促、面色苍白、心率增快等循环、呼吸衰竭相关表现。
发病年龄方面
水痘多见于2-6岁儿童，但各年龄组均可发病，未接种过水痘疫苗且未患过水痘的人群普遍易感。
手足口病以5岁以下儿童尤其是3岁以下儿童多见。
流行病学方面
传播途径：
水痘主要通过呼吸道飞沫和直接接触传播，也可通过接触被污染的用具传播。
手足口病主要通过消化道（粪-口途径）传播，也可通过密切接触传播，如接触患者的口鼻分泌物、皮肤或黏膜疱疹液等，还可通过呼吸道飞沫传播。
流行季节：
水痘全年均可发病，但以冬春季节多见。
手足口病全年均有发生，一般5-7月为高发季节，但不同地区可能有所差异。
预后方面
水痘大多预后良好，结痂脱落后一般不留瘢痕，少数患者可发生水痘肺炎、脑炎等并发症。
手足口病多数患者预后良好，呈自限性经过，但少数EV71感染的患者可发展为重症病例，甚至危及生命，重症病例可能会遗留神经系统后遗症等。
对于特殊人群，比如婴幼儿，由于其免疫系统尚未完全发育成熟，感染水痘或手足口病后更易出现重症情况。在照顾婴幼儿时，要密切观察其症状变化，若出现高热不退、精神萎靡、呼吸急促等异常情况需及时就医。对于孕妇，如果感染水痘，可能会对胎儿造成不良影响，如导致胎儿畸形等，需特别重视。
