慢性肾盂肾炎的发生与感染因素、尿路梗阻因素、机体自身因素有关。感染因素中常见致病菌入侵，急性肾盂肾炎未彻底治疗或有尿路梗阻等易转为慢性；尿路梗阻包括机械性梗阻（结石、狭窄）和功能性梗阻（神经源性膀胱）致尿液潴留引发感染；机体自身因素有免疫功能低下（基础疾病、年龄影响）和尿路黏膜防御功能异常（菌群失调、血流改变）易引发慢性肾盂肾炎。
一、感染因素
（一）致病菌入侵
1.常见致病菌：大肠杆菌是慢性肾盂肾炎最常见的致病菌，此外变形杆菌、克雷伯菌等也较为常见。这些致病菌可通过上行感染、血行感染等途径进入肾脏引发感染。例如，女性由于尿道短而直，更容易发生上行感染，细菌从尿道口进入，沿尿道上行至膀胱、输尿管，最终到达肾脏引起肾盂肾炎。
2.感染持续或反复发作：如果急性肾盂肾炎没有得到彻底治疗，致病菌持续存在于肾脏内，就容易转为慢性肾盂肾炎。另外，一些患者可能存在尿路梗阻等基础情况，使得感染容易反复发作，长期的炎症刺激会导致肾脏组织逐渐发生病理改变，进而发展为慢性肾盂肾炎。比如尿路结石患者，结石阻塞尿路，尿液引流不畅，细菌容易在局部滋生繁殖，反复引起肾盂肾炎。
二、尿路梗阻因素
（一）机械性梗阻
1.结石：泌尿系统结石，如肾结石、输尿管结石等，可阻塞尿路，导致尿液排出受阻。尿液潴留会使细菌容易在局部生长繁殖，且由于尿液引流不畅，肾脏内压力增高，影响肾脏的正常功能，长期下去可引发慢性肾盂肾炎。例如，肾结石患者中，约有一定比例会逐渐发展为慢性肾盂肾炎，就是因为结石造成了尿路梗阻。
2.狭窄：先天性尿路狭窄，如肾盂输尿管连接部狭窄；后天性尿路狭窄，如因炎症、手术等导致的尿路狭窄，都会引起尿路梗阻。狭窄部位以上的尿路扩张，尿液积聚，为细菌感染创造了条件，进而引发肾盂肾炎并逐渐转为慢性。
（二）功能性梗阻
1.神经源性膀胱：多见于脊髓损伤、糖尿病神经病变等患者，由于支配膀胱的神经功能障碍，导致膀胱排尿功能异常，出现尿潴留。尿液潴留使得细菌容易在膀胱内繁殖，然后上行感染肾脏，长期的这种感染状态可发展为慢性肾盂肾炎。比如脊髓损伤患者，由于控制膀胱的神经受损，膀胱不能正常排空，容易反复发生肾盂肾炎，最终发展为慢性。
三、机体自身因素
（一）免疫功能低下
1.基础疾病影响：患有糖尿病、艾滋病等基础疾病的患者，机体免疫功能受到抑制，对致病菌的抵抗力下降。例如糖尿病患者，高血糖环境有利于细菌生长，且其免疫细胞功能也会受到影响，更容易发生肾盂肾炎，且一旦发生，容易转为慢性。
2.年龄因素：老年人机体免疫功能减退，肾脏的结构和功能也逐渐退化，对感染的防御能力下降。老年人发生急性肾盂肾炎后，较年轻人更易发展为慢性肾盂肾炎。比如老年女性，由于绝经后雌激素水平降低，尿道黏膜萎缩，局部抵抗力下降，加上机体免疫功能衰退，更容易出现肾盂肾炎迁延不愈转为慢性的情况。
（二）尿路黏膜防御功能异常
1.局部黏膜屏障破坏：长期使用抗生素等情况可能导致尿路黏膜局部的正常菌群失调，破坏黏膜的防御屏障。比如长期滥用抗生素的患者，尿路中的正常有益菌被抑制，致病菌容易趁机繁殖，引发肾盂肾炎，若未得到有效控制，可发展为慢性。
2.黏膜血流改变：一些全身性疾病或局部因素可能导致尿路黏膜血流减少，影响黏膜的正常功能。例如高血压患者，肾小动脉硬化，尿路黏膜血流灌注不足，防御能力下降，容易发生肾盂肾炎并转为慢性。
