儿童肾病综合征分为原发性和继发性。原发性包括多见于儿童的微小病变型肾病，以及儿童相对少见的非微小病变型肾病中的系膜增生性肾小球肾炎、局灶节段性肾小球硬化、儿童时期较少见的膜性肾病；继发性有感染因素（细菌、病毒、寄生虫感染）、过敏性疾病（过敏性紫癜性肾炎、系统性红斑狼疮性肾炎）、遗传因素（如先天性肾病综合征）及其他因素（药物、代谢性疾病等）引发。
一、原发性肾病综合征
（一）微小病变型肾病
多见于儿童，约占儿童原发性肾病综合征的80%-90%。其发病机制可能与机体的免疫功能紊乱有关，尤其是T淋巴细胞功能异常导致的免疫调节失衡，使得肾小球滤过膜的电荷屏障和机械屏障受损，大量蛋白质从尿中丢失。
（二）非微小病变型肾病
1.系膜增生性肾小球肾炎
儿童相对少见，但也可引起肾病综合征。可能与感染等因素诱发的免疫反应有关，免疫复合物沉积于肾小球系膜区，导致系膜细胞增生、基质增多，进而影响肾小球的滤过功能。
2.局灶节段性肾小球硬化
在儿童肾病综合征中所占比例相对较小，发病机制可能涉及遗传因素、免疫异常等，肾小球局部节段出现硬化病变，破坏肾小球的正常结构和功能，导致蛋白尿等肾病综合征表现。
3.膜性肾病
儿童时期较少见，发病可能与自身免疫相关，血中存在与膜性肾病相关的自身抗体，攻击肾小球基底膜，造成基底膜损伤，蛋白质漏出增加。
二、继发性肾病综合征
（一）感染因素
1.细菌感染
如链球菌感染后，可引起肾小球免疫损伤，导致肾病综合征。此外，其他细菌感染，如葡萄球菌、肺炎双球菌等感染，也可能通过免疫反应诱发肾病综合征。
2.病毒感染
某些病毒感染也与儿童肾病综合征相关，例如乙型肝炎病毒感染，乙肝病毒相关抗原抗体复合物沉积于肾小球，引发肾小球病变，出现肾病综合征表现；人类免疫缺陷病毒（HIV）感染也可能累及肾脏，导致肾病综合征，但相对少见。
3.寄生虫感染
如疟原虫、血吸虫等感染，寄生虫在体内的代谢产物或虫体本身可作为抗原，引起机体免疫反应，损伤肾小球，导致蛋白尿等肾病综合征表现。
（二）过敏性疾病
1.过敏性紫癜性肾炎
好发于儿童及青少年，是儿童继发性肾病综合征的常见原因之一。当儿童接触过敏原，如食物（鱼虾、蛋类等）、药物、花粉等，引发过敏性紫癜，同时累及肾脏时，就会出现肾病综合征的表现，其发病机制与免疫复合物介导的血管炎有关，免疫复合物沉积于肾小球系膜区和血管壁，导致肾小球损伤。
2.系统性红斑狼疮性肾炎
虽然儿童发病率相对低于成人，但也可发生。系统性红斑狼疮是一种自身免疫性疾病，儿童患者体内存在多种自身抗体，攻击自身组织包括肾脏，导致肾小球病变，出现肾病综合征表现，病情往往较为复杂，还常伴有多系统受累的表现，如面部红斑、关节疼痛、发热等。
（三）遗传因素
某些遗传性肾病综合征，如先天性肾病综合征（芬兰型），是由遗传基因突变引起，患儿出生后不久即可出现肾病综合征表现，其遗传方式多为常染色体隐性遗传，由于基因突变导致肾小球滤过膜相关蛋白合成异常，使肾小球滤过功能严重受损。
（四）其他因素
1.药物因素
某些药物可能引起儿童肾脏损伤，导致肾病综合征，如含金制剂、青霉胺等药物，可能通过免疫反应机制损伤肾小球，引起蛋白尿等肾病综合征表现，但相对较为罕见。
2.代谢性疾病
如糖尿病肾病在儿童中较少见，但某些遗传性代谢性疾病可能累及肾脏，导致肾病综合征，例如脂肪营养不良相关的肾病综合征，与体内脂肪代谢异常及相关基因缺陷有关，可出现蛋白尿、低蛋白血症等肾病综合征表现。
