小脑萎缩的引发因素多样，包括遗传因素致如脊髓小脑性共济失调等遗传性疾病引发、变性疾病如多系统萎缩中的小脑型多系统萎缩导致、神经系统感染包括病毒感染如病毒性脑炎、细菌感染如化脓性脑膜炎遗留后遗症、中毒如药物中毒、重金属中毒、脑血管疾病如脑梗死、脑出血破坏小脑结构、营养缺乏如维生素缺乏、老龄化导致的生理性退行性变化等。
变性疾病
多系统萎缩：是一种神经系统变性疾病，其中的小脑型多系统萎缩会导致小脑萎缩。其病理改变主要是中枢神经系统多个部位的神经元变性、缺失，累及小脑时就会引起小脑组织的萎缩。患者除了有小脑性共济失调的表现外，还可能伴有自主神经功能障碍、帕金森综合征等其他系统的症状，病情会逐渐进展，小脑萎缩也会随之加重。
神经系统感染
病毒感染：如病毒性脑炎如果没有得到及时有效的治疗，可能会遗留小脑萎缩的后遗症。某些病毒侵犯中枢神经系统后，会引发炎症反应，长期的炎症刺激会导致小脑组织受损、神经元凋亡，进而出现小脑萎缩。例如乙型脑炎病毒感染后，部分患者在恢复期可能会出现小脑萎缩相关的运动功能异常等表现。
细菌感染：中枢神经系统的细菌感染，如化脓性脑膜炎，严重时也可能导致小脑萎缩。细菌感染引起的炎症会破坏小脑的正常结构和功能，使得小脑组织逐渐发生萎缩改变。
中毒
药物中毒：长期大量使用某些具有神经毒性的药物可能导致小脑萎缩，比如长期滥用抗癫痫药物苯妥英钠，可能会对小脑产生毒性作用，引起小脑萎缩。药物在体内蓄积，干扰了小脑神经元的正常代谢和功能，最终导致小脑组织萎缩。
重金属中毒：长期接触汞、铅等重金属，这些重金属会在体内蓄积，通过影响神经系统的正常生理过程，损害小脑神经元，从而引发小脑萎缩。例如职业暴露于含汞环境的工人，如果防护不当，长期接触汞，就有患小脑萎缩的风险。
脑血管疾病
脑梗死：小脑部位的脑梗死会导致局部脑组织缺血缺氧坏死，长期如此会引起小脑萎缩。当供应小脑的血管发生堵塞，导致小脑组织血流中断，神经元因缺血而死亡，随着时间推移，受损区域会逐渐发生萎缩。比如小脑后下动脉梗死，就可能累及小脑，导致小脑萎缩及相应的临床症状。
脑出血：小脑部位的脑出血会破坏小脑的正常结构，血液的刺激以及血肿周围的脑组织水肿等会损伤小脑神经元，进而引起小脑萎缩。出血吸收后，局部脑组织缺失，胶质瘢痕形成，导致小脑体积缩小、萎缩。
营养缺乏
维生素缺乏：长期酗酒导致维生素B1缺乏，可引起韦尼克脑病，若病情迁延不愈可能发展为小脑萎缩。维生素B1是维持神经系统正常功能所必需的营养物质，缺乏时会影响神经元的代谢，导致小脑等神经系统结构受损、萎缩。此外，长期营养不良、胃肠道吸收障碍等导致维生素B12缺乏，也可能对神经系统造成损害，包括引起小脑萎缩。
其他营养物质缺乏：长期缺乏蛋白质等营养物质，会影响神经系统的正常发育和维持，可能间接导致小脑组织的营养供应不足，从而引发小脑萎缩。例如一些长期处于营养不良状态的人群，尤其是儿童，如果营养状况得不到改善，可能会出现包括小脑在内的神经系统发育异常或萎缩。
老龄化因素
随着年龄的增长，人体神经系统会出现自然的退行性变化，小脑也不例外。老年人的小脑组织会逐渐发生萎缩，这是一种生理性的衰老表现。一般来说，60岁以上的老年人小脑萎缩的发生率会有所增加，但这并不意味着所有老年人都会出现严重的临床症状，只有当萎缩程度达到一定程度并影响到正常的运动、平衡等功能时才会表现出明显的小脑萎缩相关症状。在老年人中，需要关注其平衡能力、运动协调能力等方面的变化，及时发现小脑萎缩相关的问题并采取相应的干预措施来维持生活质量。
