咽喉牙龈肿痛口腔溃疡的原因包括局部因素和全身因素。局部因素有感染（细菌、病毒）和机械性损伤（口腔刺激物、不良饮食习惯）；全身因素有营养不良（维生素、微量元素缺乏）、免疫系统异常（自身免疫性疾病、免疫功能低下）及其他全身疾病（糖尿病、消化系统疾病）。
一、局部因素
1.感染因素
细菌感染：口腔内存在大量细菌，当机体抵抗力下降时，如儿童免疫系统发育尚未完善，易受细菌侵袭。例如金黄色葡萄球菌、链球菌等感染可引起牙龈的急性炎症，出现牙龈肿痛，若炎症波及咽喉部，也会导致咽喉肿痛，同时可能引发口腔黏膜的溃疡。在成年人中，长期不注意口腔卫生，牙菌斑、牙结石堆积，为细菌滋生提供了良好环境，也容易引发感染相关的咽喉牙龈肿痛及口腔溃疡。
病毒感染：常见的如单纯疱疹病毒感染，儿童由于自身免疫力相对较低，更容易被感染。单纯疱疹病毒感染后，可在口腔黏膜及咽喉部形成疱疹，进而发展为溃疡，同时伴有局部的红肿热痛等炎症表现。
2.机械性损伤
口腔内的刺激物：儿童在长牙期，牙齿萌出过程中可能会摩擦口腔黏膜，导致局部的损伤，引发溃疡，若损伤波及牙龈，可引起牙龈肿痛，严重时炎症可能扩散至咽喉部，引起咽喉肿痛。成年人如果佩戴不合适的假牙，假牙边缘不光滑，长期摩擦口腔黏膜和牙龈，也会造成损伤，出现肿痛和溃疡，并且可能影响咽喉部位的正常状态。
不良的饮食习惯：过烫的食物会直接烫伤口腔黏膜和咽喉黏膜，导致局部出现红肿、疼痛，进而可能形成溃疡。例如喜欢吃火锅、热汤面等过烫食物的人群，更容易出现这种情况。另外，食用尖锐、坚硬的食物，如坚果、脆骨等，可能会划伤口腔黏膜和牙龈，引发损伤性的肿痛和溃疡。
二、全身因素
1.营养不良
维生素缺乏：尤其是维生素B族（如维生素B2、B6等）和维生素C缺乏。儿童处于生长发育阶段，若饮食中摄入的蔬菜、水果不足，容易导致维生素缺乏。维生素B族参与机体的新陈代谢，缺乏时会影响口腔黏膜的正常代谢，导致口腔黏膜抵抗力下降，引发口腔溃疡，同时可能伴随牙龈的炎症，进而影响咽喉部位；成年人长期偏食、节食，也会造成维生素缺乏，出现咽喉牙龈肿痛口腔溃疡等问题。
微量元素缺乏：锌等微量元素缺乏也与咽喉牙龈肿痛口腔溃疡有关。锌是人体多种酶的组成成分，参与细胞的生长和修复。儿童如果挑食导致锌摄入不足，会影响口腔黏膜的修复功能，容易发生口腔溃疡，并且可能伴随免疫功能下降，增加咽喉部感染的风险，进而出现咽喉肿痛和牙龈炎症；成年人长期营养不良，锌等微量元素缺乏，同样会出现相关症状。
2.免疫系统异常
自身免疫性疾病：如白塞病，这是一种慢性自身免疫性疾病，可累及口腔、咽喉、眼部等多个部位。患者会出现反复发作的口腔黏膜溃疡、牙龈肿痛，同时伴有咽喉部的炎症表现，如疼痛、异物感等。这种疾病在各个年龄段均可发病，青年人群相对多见，其发病机制与自身免疫系统攻击自身组织有关。
免疫功能低下：老年人由于机体功能衰退，免疫功能下降；患有艾滋病等免疫缺陷疾病的人群，免疫功能严重受损。这些人群容易受到各种病原体的侵袭，导致口腔内感染，出现咽喉牙龈肿痛口腔溃疡等情况，而且病情往往较为顽固，不易治愈。
3.其他全身疾病
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，机体抵抗力下降，口腔内的高血糖环境有利于细菌滋生，容易引发口腔感染，出现牙龈炎症、口腔溃疡，同时高血糖状态也可能影响咽喉部的血液循环和免疫功能，导致咽喉肿痛。糖尿病患者无论年龄大小，都需要严格控制血糖，以减少口腔及全身并发症的发生。
消化系统疾病：如胃溃疡、十二指肠溃疡等消化系统疾病，会影响营养物质的吸收，导致机体营养不良，进而引发口腔问题。同时，消化系统疾病引起的胃肠功能紊乱，可能导致体内激素水平失衡等，也会间接影响口腔和咽喉的健康，出现咽喉牙龈肿痛口腔溃疡等症状。例如，患有胃溃疡的人群，由于消化吸收功能受到影响，维生素等营养物质摄入不足，容易出现口腔黏膜的病变。
