肾囊肿疼痛部位多在腰部或上腹部，性质有隐痛、胀痛、钝痛，发作与囊肿大小、体位变化相关，还可能伴血尿、腹部包块等症状，较小囊肿疼痛少，增大时发作频度、程度可能变化，体位改变可影响疼痛，伴血尿时需鉴别，较大囊肿可致腹部摸到包块伴痛。
肾囊肿引起的疼痛部位多位于腰部或上腹部。通常是单侧腰部的隐痛、胀痛或钝痛，少数情况下也可能出现双侧疼痛，但相对少见。对于儿童患者，其表述疼痛部位可能不够精确，但常见是腰腹部区域的不适。女性患者在生理期等特殊时期，可能会对疼痛的感知和描述有一定影响，但肾囊肿相关疼痛的基本部位特征不受性别本质影响。生活方式中长期久坐、久站等可能会加重腰部肌肉紧张，从而使肾囊肿相关疼痛感觉更明显，有肾脏病史的患者肾囊肿疼痛时，疼痛部位的特点可能与无病史人群相似，但需结合病史综合判断。
疼痛性质
隐痛或胀痛：多数肾囊肿患者的疼痛为隐痛或胀痛，这种疼痛往往是比较轻微的，呈持续性。例如一些较小的肾囊肿，患者可能仅感觉腰部有隐隐的不适或胀痛感，这种疼痛程度一般可以忍受，不会突然加剧到难以忍受的剧烈疼痛，但会持续存在。对于儿童患者，由于表达能力有限，可能表现为腰部的持续不适，家长需注意观察。女性患者在孕期等特殊时期，身体状态改变可能会使这种隐痛或胀痛的感觉有所不同，但核心的性质还是以隐痛或胀痛为主。有肾脏基础疾病的患者，肾囊肿引起的隐痛或胀痛可能会因基础病的影响而在程度或持续时间上有差异。
钝痛：部分肾囊肿较大时，可能会出现钝痛。这种钝痛相对隐痛或胀痛来说，程度稍重一些，但仍然是一种较为持续的疼痛感觉。比如当肾囊肿体积增大到一定程度，对肾脏包膜产生牵拉等刺激时，就可能出现钝痛。儿童患者如果肾囊肿较大导致钝痛，可能会影响其活动和情绪。女性患者在不同生理阶段，钝痛的感受可能会因为身体激素水平等变化而有细微差别，但总体还是以钝痛的性质为主。有肾脏病史者，肾囊肿导致的钝痛可能与无病史者在机制上相似，但需结合病史来鉴别是原有病史加重还是新出现的肾囊肿相关问题。
疼痛发作规律
与囊肿大小相关：一般来说，较小的肾囊肿引起疼痛的情况较少，疼痛发作不频繁；随着肾囊肿体积逐渐增大，疼痛发作的频率可能会增加，疼痛程度也可能会加重。例如，当肾囊肿直径小于5厘米时，可能很少出现疼痛症状，而当直径超过5厘米甚至更大时，疼痛发作的可能性明显增加。儿童患者如果肾囊肿生长速度较快，那么疼痛发作规律可能会更明显地呈现出随囊肿增大而疼痛相关表现加重的情况。女性患者在孕期，由于肾脏负担加重，肾囊肿可能会增大，从而影响疼痛发作规律，使疼痛更易出现或加重。有肾脏病史者，肾囊肿增大时疼痛发作规律可能受到原有肾脏病变的干扰，需要更细致地观察和评估。
与体位变化有关：部分患者改变体位时疼痛可能会有变化。比如卧位转为坐位或站立位时，由于肾囊肿对肾脏位置等的影响，可能会导致疼痛程度有所改变。有些患者卧位时疼痛相对较轻，而站立或坐位时疼痛会加重，这是因为体位改变影响了囊肿与周围组织的关系，进而影响疼痛感觉。儿童患者在体位变化时，可能会出现哭闹等表现来提示身体不适，家长需留意这种与体位相关的疼痛变化。女性患者在不同体位时的疼痛感受可能因个体差异有所不同，但总体体位变化对疼痛的影响机制是相似的。有肾脏病史者，体位变化时的疼痛反应可能与无病史者不同，需要结合病史来判断是否与原有肾脏病变相关。
伴随症状
血尿：少数肾囊肿患者在出现疼痛时可能会伴有血尿。这是因为增大的肾囊肿可能会导致肾脏血管破裂等情况，从而引起血尿。血尿的颜色可以是淡红色、鲜红色等不同程度。儿童患者如果出现肾囊肿疼痛伴血尿，需要高度重视，及时就医检查。女性患者在生理期时，血尿可能会被误认为是生理期相关，但如果同时有肾囊肿疼痛，就需要鉴别是肾囊肿引起的血尿还是生理期问题。有肾脏病史者，血尿伴肾囊肿疼痛可能提示病情有变化，需要进一步排查是原有病史活动还是新的肾囊肿相关问题导致。
腹部包块：当肾囊肿较大时，有时可以在腹部摸到包块，同时伴有疼痛。这是因为增大的囊肿突出于肾脏表面，被触摸到，并且由于囊肿对周围组织的刺激而产生疼痛。儿童患者腹部摸到包块伴疼痛时，家长要引起重视，及时带孩子就医检查肾囊肿情况。女性患者腹部摸到包块伴疼痛时，需注意与妇科相关疾病鉴别，但肾囊肿导致的包块伴疼痛有其自身特点，即与肾囊肿相关的位置等特征。有肾脏病史者，腹部包块伴肾囊肿疼痛可能与原有肾脏病变引起的包块等情况不同，需要结合病史进行区分。
