有胎心胎芽后胎停的原因包括胚胎因素（染色体异常、基因缺陷）、母体因素（内分泌异常、自身免疫性疾病、感染因素、全身性疾病、子宫异常）、父亲因素（精子染色体异常）、环境因素（化学物质接触、辐射暴露）。
一、胚胎因素
1.染色体异常：胚胎染色体数目或结构异常是早期胎停最常见的原因，约占50%-60%。无论是父母遗传而来的染色体异常，还是胚胎在发育过程中自发产生的染色体突变，都可能导致胚胎发育异常，进而出现有胎心胎芽后胎停的情况。例如，常见的三体综合征等染色体数目异常疾病，会严重干扰胚胎正常的生长发育进程。
2.基因缺陷：某些基因的缺陷也可能影响胚胎的正常发育。基因层面的问题可能涉及胚胎发育相关的关键基因功能异常，使得胚胎无法按照正常的轨迹进行分化和生长，从而引发胎停。
二、母体因素
1.内分泌异常
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对维持妊娠至关重要。若母体黄体功能不全，孕酮分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，就可能导致有胎心胎芽后胎停。研究表明，黄体功能不全的女性发生胎停的风险较正常女性显著升高。
甲状腺功能异常：甲状腺激素对胚胎的生长发育有着重要的调节作用。甲状腺功能减退时，机体内甲状腺激素水平降低，会影响胚胎的代谢、分化等过程；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常发育，增加胎停的发生几率。
2.自身免疫性疾病
系统性红斑狼疮：患有系统性红斑狼疮的孕妇，自身免疫系统会攻击自身组织和胚胎相关组织，引发炎症反应，影响胎盘的血液供应和胚胎的营养物质输送，从而导致有胎心胎芽后胎停。这类自身免疫性疾病会破坏妊娠的免疫耐受状态，对胚胎造成不利影响。
抗磷脂综合征：患者体内存在抗磷脂抗体，会导致胎盘血管内血栓形成，影响胎盘的血流灌注，使胚胎得不到充足的营养和氧气供应，最终引发胎停。抗磷脂抗体可通过多种途径干扰胎盘的正常功能，是导致妊娠不良结局的重要因素之一。
3.感染因素
TORCH感染：TORCH包括弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。孕妇在孕期感染这些病原体后，病原体可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎的正常发育，导致有胎心胎芽后胎停。例如，孕妇感染风疹病毒，可能会引起胚胎的多种畸形和发育异常，增加胎停的风险。
其他细菌或病毒感染：如孕期感染大肠杆菌、流感病毒等，也可能通过不同的机制影响子宫内环境和胚胎发育，导致胎停情况的发生。细菌或病毒感染可能引发子宫的炎症反应，干扰胚胎的生长微环境。
4.全身性疾病
糖尿病：患有糖尿病的孕妇，如果血糖控制不佳，高血糖环境会影响胚胎的发育。高血糖可导致胚胎细胞外基质改变、氧化应激增加等，干扰胚胎的正常分化和器官形成，增加有胎心胎芽后胎停的可能性。长期的高血糖状态对胚胎的血管系统、神经系统等多方面发育都有不良影响。
高血压：妊娠合并高血压会影响胎盘的血流灌注，使胎盘供血不足，胚胎得不到足够的营养和氧气，从而增加胎停的风险。高血压会导致血管收缩，减少子宫-胎盘的血流量，影响胚胎的正常发育。
5.子宫异常
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等子宫畸形情况，会影响子宫的宫腔形态和容积，使得胚胎着床和发育的空间受限，容易发生胎停。子宫畸形会改变子宫内的血流分布和微环境，不利于胚胎的稳定生长。
宫腔粘连：宫腔粘连会导致子宫内膜损伤，内膜的厚度和容受性降低，胚胎难以着床或着床后难以正常发育，进而出现有胎心胎芽后胎停的情况。宫腔粘连可能是由于刮宫等宫腔操作引起的内膜损伤修复不良所致。
三、父亲因素
精子染色体异常也可能导致胚胎发育异常，从而引起有胎心胎芽后胎停。父亲的不良生活习惯，如长期吸烟、酗酒、接触放射性物质或有毒有害物质等，都可能导致精子质量下降，染色体发生突变的概率增加，进而影响胚胎的正常发育。
四、环境因素
1.化学物质接触：孕妇长期接触铅、汞、苯等有毒化学物质，或接触某些农药、甲醛等有害物质，这些化学物质可能通过胎盘影响胚胎发育，导致有胎心胎芽后胎停。例如，长期处于甲醛超标的环境中，甲醛会干扰胚胎的细胞代谢和基因表达，对胚胎发育产生不利影响。
2.辐射暴露：孕妇接触过量的辐射，如放射性物质、X射线等，辐射会损伤胚胎的细胞结构和遗传物质，影响胚胎的正常发育过程，增加胎停的发生风险。在一些特殊职业环境中，如放射科工作人员的家属，若孕妇接触过量辐射，就需要特别警惕胚胎发育异常的情况。
