习惯性流产的发生与多种因素相关，包括遗传因素如夫妻双方染色体异常；解剖因素如子宫畸形、宫腔粘连；内分泌因素如黄体功能不全、甲状腺功能异常；免疫因素如自身免疫性疾病（系统性红斑狼疮、抗磷脂综合征）、同种免疫异常；感染因素如弓形虫、风疹病毒、支原体衣原体感染；还有生活方式因素（吸烟饮酒、过度劳累）、心理因素（长期精神压力过大）、环境因素（接触有害物质）等。
解剖因素
子宫解剖结构异常
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等。子宫畸形会使子宫腔形态异常，影响胚胎的着床和发育环境。例如，纵隔子宫由于宫腔内存在纵隔组织，会占据部分宫腔空间，导致胚胎种植面积减少，增加流产风险。这种情况在青春期女性中也可能存在，且可能在孕前通过超声等检查发现。
宫腔粘连：多由于宫腔操作史（如人工流产、清宫术等）导致子宫内膜损伤，引起宫腔部分或全部粘连。宫腔粘连会使宫腔容积减小，子宫内膜功能受损，影响胚胎的生长发育，从而引发习惯性流产。有过多次宫腔操作病史的女性发生宫腔粘连进而导致习惯性流产的风险较高。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕激素分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境。研究表明，约10%-20%的习惯性流产与黄体功能不全有关。这种情况在有内分泌疾病史（如多囊卵巢综合征等）的女性中更易发生，且可能伴随月经周期的改变等表现。
甲状腺功能异常
甲状腺功能减退：甲状腺激素水平异常会影响胚胎的发育。甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，可能导致胚胎发育迟缓、流产等。临床研究发现，甲状腺功能减退的女性习惯性流产的发生率明显高于甲状腺功能正常的女性。特别是患有自身免疫性甲状腺疾病的女性，发生甲状腺功能减退的概率较高，进而增加习惯性流产风险。
甲状腺功能亢进：严重的甲状腺功能亢进会使孕妇处于高代谢状态，也可能导致流产等不良妊娠结局。甲状腺功能亢进的女性体内甲状腺激素水平过高，会影响胚胎的正常发育过程。
免疫因素
自身免疫性疾病
系统性红斑狼疮：这是一种自身免疫性结缔组织病，患者体内存在多种自身抗体，这些抗体可通过多种途径影响胎盘的正常功能，导致胚胎着床失败或流产。系统性红斑狼疮患者发生习惯性流产的概率显著升高，且病情活动期时风险更高。女性患者在患病期间怀孕，需要密切监测病情和自身抗体水平。
抗磷脂综合征：体内存在抗心磷脂抗体、狼疮抗凝物等自身抗体，这些抗体可引起胎盘血管血栓形成，胎盘血流灌注不足，从而导致反复流产。抗磷脂综合征是导致习惯性流产的重要免疫因素之一，在育龄女性中发病率相对较低，但一旦患病，习惯性流产的风险极高。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受失衡也可能导致习惯性流产。正常妊娠时，母体免疫系统对胚胎抗原产生耐受，若这种耐受机制出现异常，母体免疫系统将胚胎视为“异物”进行攻击，从而引发流产。这种情况在一些原因不明的习惯性流产中较为常见，可能与母体的免疫调节功能异常有关。
感染因素
病原体感染
弓形虫感染：孕妇感染弓形虫后，弓形虫可通过胎盘感染胎儿，引起胎儿发育异常、流产等。弓形虫感染在一些接触宠物较多或食用未充分煮熟肉类的女性中风险较高，特别是在孕期感染时，对胎儿的影响更为严重。
风疹病毒感染：孕期感染风疹病毒可导致胎儿先天性风疹综合征，引起流产、死胎或胎儿出生后多种先天性畸形。育龄女性在孕前若未感染过风疹病毒且未接种风疹疫苗，孕期感染风疹病毒的风险增加，从而可能导致习惯性流产。
支原体、衣原体感染：生殖道感染支原体、衣原体等病原体，可引起子宫内膜炎等，影响胚胎的着床和发育。有不洁性生活史或多个性伴侣的女性感染支原体、衣原体的概率较高，进而增加习惯性流产的风险。
其他因素
生活方式因素
吸烟饮酒：女性吸烟会使血管收缩，减少子宫胎盘的血流灌注，影响胚胎的营养供应；饮酒可通过胎盘影响胎儿发育，增加流产风险。长期吸烟饮酒的女性发生习惯性流产的概率明显高于不吸烟不饮酒的女性，且这种影响在年龄较大的女性中更为显著。
过度劳累：长期过度劳累会使孕妇身体处于应激状态，影响内分泌平衡和免疫系统功能，从而增加习惯性流产的风险。特别是从事高强度工作或经常熬夜的女性，更易出现这种情况。
心理因素
长期精神压力过大：孕妇长期处于精神压力过大的状态下，会导致体内激素水平失衡，影响下丘脑-垂体-性腺轴的功能，进而影响妊娠。研究发现，精神压力过大的女性习惯性流产的发生率高于精神状态良好的女性。例如，面临工作压力、家庭矛盾等多种压力的孕妇，发生习惯性流产的风险可能增加。
环境因素
接触有害物质：长期接触铅、汞、苯等有害物质，会影响胚胎的发育，增加流产风险。例如，在职业环境中接触这些有害物质的女性，如从事油漆、印刷等工作的女性，孕期接触后发生习惯性流产的概率较高。
