再生障碍性贫血的发病与多种因素相关，药物因素中某些化学药物及个体差异可致；化学物质接触方面职业和环境接触特定毒物会损伤骨髓造血；病毒感染时特定病毒直接或通过免疫反应侵犯造血干细胞；遗传因素中遗传性疾病及基因缺陷会影响造血调控；还有自身免疫异常、年龄性别及生活方式等因素也与之有关。
个体差异影响：不同个体对药物的敏感性存在差异，有些患者可能在使用相对常规剂量的相关药物后就出现骨髓抑制等情况引发再生障碍性贫血，这与个体的基因多态性等因素有关，基因的差异可能影响药物在体内的代谢、转运以及对造血干细胞的作用方式等。
化学物质接触
职业性接触：长期接触某些化学毒物的职业人群易患再生障碍性贫血，比如从事油漆、染料、橡胶加工等行业的工人，长期接触苯及其衍生物，苯进入人体后可在骨髓中蓄积，抑制骨髓造血干细胞的有丝分裂，损害骨髓造血微环境，导致造血干细胞数量减少和功能异常，进而引发再生障碍性贫血。
环境性接触：在日常生活环境中接触到某些化学毒物也可能致病，如长期处于被农药、含苯胶水等污染的环境中，长期低剂量的接触也可能逐渐损伤骨髓造血功能，增加患再生障碍性贫血的风险。
病毒感染
特定病毒类型：某些病毒感染与再生障碍性贫血的发生密切相关，其中肝炎病毒较为常见，包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒等。病毒感染后可能直接侵犯骨髓造血干细胞，导致干细胞损伤；也可能通过免疫机制介导，引发自身免疫反应攻击造血干细胞，使骨髓造血功能受到抑制。例如，部分丙型肝炎患者在病程中会出现再生障碍性贫血的并发症，其发病机制可能涉及病毒抗原与机体免疫系统相互作用，产生异常免疫反应损伤造血系统。
感染后的免疫反应：病毒感染机体后，机体的免疫系统被激活，产生的细胞因子等可能会破坏骨髓造血微环境，影响造血干细胞的正常增殖和分化，从而导致再生障碍性贫血的发生。不同患者感染病毒后的免疫反应强度和方式存在差异，这也会影响疾病的发生和发展。
遗传因素
遗传性疾病关联：一些遗传性疾病可导致再生障碍性贫血，如范可尼贫血，这是一种常染色体隐性遗传性疾病，患者存在DNA修复机制缺陷，骨髓造血干细胞容易发生基因突变和损伤，导致造血功能衰竭。患者通常在儿童期或青少年期就可能出现贫血、出血、感染等再生障碍性贫血的相关表现，且具有家族遗传倾向。
基因缺陷影响：遗传因素导致的基因缺陷会使机体的造血调控机制出现异常，影响造血干细胞的正常功能和分化过程，使得骨髓造血不能正常产生足够数量和质量的血细胞，从而引发再生障碍性贫血。不同的遗传基因突变位点可能影响不同的造血调控环节，导致疾病表现和严重程度有所不同。
其他因素
自身免疫异常：自身免疫性疾病患者发生再生障碍性贫血的风险可能增加，患者自身的免疫系统产生攻击自身造血干细胞的自身抗体，这些抗体结合到造血干细胞表面，导致造血干细胞被破坏或功能受到抑制，影响骨髓的造血功能。例如，部分系统性红斑狼疮患者在疾病过程中可能出现再生障碍性贫血的并发症，其自身免疫紊乱产生的自身抗体参与了对造血干细胞的损伤。
年龄与性别因素：不同年龄段和性别的人群患病风险略有差异，但总体来说，再生障碍性贫血可发生于任何年龄阶段。一般儿童和老年人相对更易受到各种致病因素的影响而发病。在性别方面，目前并没有明显的性别差异导致再生障碍性贫血发病率有显著不同，但不同性别患者在面对相同致病因素时，可能由于机体的生理差异在疾病的发生发展和预后等方面存在一定差异。
生活方式因素：长期不良的生活方式可能会间接影响造血功能，如长期过度劳累、营养不良等，营养不良会导致机体缺乏造血所需的营养物质，如叶酸、维生素B12、铁等，这些营养物质是造血过程中不可或缺的原料，缺乏时会影响骨髓造血干细胞的正常增殖和分化，长期如此可能增加患再生障碍性贫血的风险。而长期过度劳累会使机体处于应激状态，影响内分泌和免疫系统功能，也可能对骨髓造血产生不利影响。
