灰指甲可由皮肤癣菌、酵母菌、其他霉菌感染引起，皮肤癣菌感染可通过直接或间接接触感染，酵母菌感染与机体免疫力下降或局部环境改变有关，霉菌感染与长期处于潮湿环境、接触某些化学物质等因素有关，自身因素中年龄方面儿童免疫系统未完全发育成熟、老年人指甲生长速度减慢且免疫力下降，性别方面男性接触感染源机会多、女性经常美甲可能增加发病几率，生活方式中长期穿不透气鞋子、经常美甲、吸烟易引发灰指甲，病史方面银屑病患者、免疫缺陷性疾病患者易合并真菌感染引发灰指甲。
一、皮肤癣菌感染
皮肤癣菌是引起灰指甲（甲真菌病）的主要病原体，其中红色毛癣菌最为常见。皮肤癣菌可通过直接接触感染患者的足部、手部皮肤癣菌病，或者间接接触被污染的物品，如拖鞋、毛巾、指甲刀等而感染甲板和甲下组织。例如，在公共浴室、游泳池等公共场所，若接触到被皮肤癣菌污染的环境，就容易引发感染。儿童如果经常在公共泳池玩耍，且脚部皮肤有微小破损，就更易被皮肤癣菌感染而患上灰指甲；老年人由于身体机能下降，皮肤屏障功能减弱，也相对更容易受到皮肤癣菌的侵袭。
二、酵母菌感染
酵母菌中的念珠菌属也可导致灰指甲。念珠菌常存在于人体的皮肤、口腔、肠道等部位，当机体免疫力下降或局部环境改变时，念珠菌可侵犯甲板。比如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体免疫力相对较低，且高血糖环境有利于念珠菌的生长繁殖，所以糖尿病患者患灰指甲中由酵母菌感染的比例可能相对较高。
三、霉菌感染
其他霉菌如青霉、曲霉等也可能引起灰指甲，但相对少见。霉菌感染往往与长期处于潮湿环境、接触某些化学物质等因素有关。从事某些需要长期接触水或潮湿工作环境的人群，如渔民、洗衣工等，甲板长期处于潮湿状态，为霉菌的生长提供了条件，增加了感染霉菌引发灰指甲的风险。
四、自身因素
1.年龄：儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，指甲的屏障功能相对较弱，且活泼好动，容易接触到感染源，所以儿童患灰指甲的几率相对较低，但一旦感染治疗相对要更加谨慎；老年人随着年龄增长，指甲的生长速度减慢，指甲的质地也会发生变化，如变得脆弱、增厚等，同时机体的免疫力下降，更容易受到真菌等病原体的侵袭而患上灰指甲。
2.性别：一般来说，性别本身不是直接导致灰指甲的决定性因素，但在一些特殊情况下可能有差异。例如，男性可能因为从事一些需要频繁接触公共物品的工作，或者有更多的户外活动，接触感染源的机会相对较多，从而增加患灰指甲的风险；女性如果经常涂抹指甲油，会影响指甲的透气性，使甲板局部环境潮湿，也可能增加灰指甲的发病几率。
3.生活方式：长期穿着不透气的鞋子，如塑料凉鞋、不透气的运动鞋等，会使脚部处于闷热、潮湿的环境中，为真菌的生长提供了良好的条件，容易引发灰指甲。经常美甲的人群，美甲过程中可能会对指甲造成损伤，破坏指甲的保护层，使得真菌更容易侵入。此外，吸烟会影响机体的血液循环和免疫系统功能，从而间接影响指甲的健康，增加患灰指甲的可能性。
4.病史：患有某些基础疾病的人群，如银屑病患者，银屑病可累及指甲，导致指甲出现凹陷、增厚等改变，同时机体的免疫状态异常，容易合并真菌感染引发灰指甲；患有免疫缺陷性疾病的患者，如艾滋病患者，由于免疫系统严重受损，对真菌的抵抗力极弱，更容易患上灰指甲，且病情往往较为严重，治疗难度较大。
