细菌引起的肠炎起病通常较急，有腹痛腹泻、黏液脓血便等症状及全身感染表现，粪便镜检有较多白细胞脓细胞等，培养可分离相应致病菌，内镜见肠黏膜充血水肿糜烂等；真菌引起的肠炎病程相对较长，腹泻次数较少，粪便多为黄色稀水便伴泡沫黏液，全身症状轻，粪便镜检可找到真菌孢子或菌丝，培养可出念珠菌，内镜可见肠黏膜有白色假膜形成等；儿童真菌肠炎与长期用广谱抗生素等有关，细菌肠炎与饮食不洁相关；免疫力低下人群病情进展迅速不易控制，需密切监测及管理基础疾病。细菌引起的肠炎起病较急，有腹痛腹泻、黏液脓血便等症状及全身感染表现，粪便镜检有较多白细胞脓细胞等，培养可分离相应致病菌，内镜见肠黏膜充血水肿糜烂；真菌引起的肠炎病程较长，腹泻次数较少，粪便多为黄色稀水便伴泡沫黏液，全身症状轻，粪便镜检可找到真菌孢子或菌丝，培养可出念珠菌，内镜可见肠黏膜有白色假膜形成；儿童真菌肠炎与长期用广谱抗生素等有关，细菌肠炎与饮食不洁相关；免疫力低下人群病情进展快需密切监测及管理基础疾病。
一、临床表现差异
1.细菌引起的肠炎：起病通常较急，患者多有腹痛、腹泻症状，粪便常表现为黏液脓血便，可伴有不同程度发热等全身感染症状，部分患者因病原菌侵袭肠黏膜，肠道炎症反应明显时会出现较频繁的腹泻且粪便中白细胞、脓细胞等炎性成分增多。不同细菌感染可能有一定特征，如志贺菌感染多表现为典型的黏液脓血便，腹泻频繁且里急后重感较明显。
2.真菌引起的肠炎：病程相对较长，腹泻次数相对细菌肠炎可能较少，粪便多为黄色稀水便，可伴有泡沫、黏液，全身症状相对较轻，一般发热等表现不突出或程度较轻，这与真菌性肠炎多因长期使用抗生素等导致肠道菌群失调，真菌定植繁殖但全身炎症反应相对细菌感染较弱有关。
二、实验室检查鉴别
1.粪便常规检查
细菌肠炎：粪便镜检可见较多白细胞、脓细胞，部分患者粪便中可检测到红细胞，提示肠黏膜有明显炎性损伤及可能的出血情况。
真菌肠炎：粪便镜检可找到真菌孢子或菌丝，这是直接提示存在真菌感染的重要依据，通过显微镜下观察粪便标本中是否有真菌的形态结构来初步判断。
2.粪便培养
细菌肠炎：进行粪便细菌培养可分离出相应的致病菌，如培养出大肠杆菌、沙门菌等特定细菌，能明确病原菌种类，为细菌肠炎的诊断提供病原学证据。
真菌肠炎：粪便真菌培养可培养出念珠菌等真菌，从而确定是真菌感染引起的肠炎。
3.内镜检查
细菌肠炎：内镜下可见肠黏膜充血、水肿、糜烂等表现，病变多呈弥漫性分布，炎症主要集中在肠黏膜表层及黏膜下层。
真菌肠炎：内镜下可见肠黏膜有白色假膜形成，假膜易剥离，剥离后可见糜烂面或溃疡等改变，这是真菌性肠炎较典型的内镜表现。
三、不同人群特点影响及应对
1.儿童群体：儿童真菌性肠炎往往与长期使用广谱抗生素、免疫力低下（如患有基础疾病、接受化疗等）密切相关，需特别注意儿童使用抗生素的合理性，避免因滥用抗生素引发真菌性肠炎。而儿童细菌肠炎可能因饮食不洁等因素导致，要关注儿童的饮食卫生情况。
2.免疫力低下人群：如老年人、艾滋病患者等，这类人群无论是细菌还是真菌引起的肠炎，病情可能进展更迅速且不易控制，需更密切监测病情，在进行实验室检查时要及时准确，以便尽早明确病因进行针对性处理，同时要注重这类人群的基础疾病管理以增强机体抵抗力。
