中心
耳鼻喉科
医学影像科
整形美容科
心脏科
呼吸与危重症医学科（PCCM）
控制吸烟与呼吸防控部
内分泌科
消化科（含内镜中心）
神经科
急诊科
感染疾病科
血液科
肾病科（含血液净化中心）
心脏血管外科
疼痛科
普外科⋅胃肠外科
骨科·关节外科
泌尿外科
耳鼻喉头颈外科
口腔医学中心
手术麻醉科
重症医学科（ICU）
介入医学科
普外科﹒代谢减重中心
骨科·脊柱外科
普外科•结直肠外科
普外科·肝胆胰外科一部
肝脏移植中心（肝胆胰外科二部）
骨科·创伤骨科
病房（日间病房）
中西医结合心脏内科
中医肺病一部
中西医结合肺病科
中医脾胃病科
中医外科
推拿科
肛肠科一部
肛肠科二部
中医老年病
中西医结合肿瘤内科
中西医结合糖尿病科
检验科
病理科
放射诊断科
核医学科
药学部
国际部
国际部病房一病区
国际部病房二部
保健部二部（A栋）
保健部三部（A栋）
康复医学科
体检中心
中日医院药物临床试验研究中心