引起发烧头痛的因素包括感染性和非感染性。感染性因素有流感病毒、普通感冒病毒等病毒感染及肺炎链球菌感染、化脓性脑膜炎等细菌感染；非感染性因素包括自身免疫性疾病（如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎）、中暑、颅脑外伤、恶性肿瘤等，不同因素导致的发烧头痛表现及相关特点各异。
流感病毒：是常见的引起发烧头痛的病原体之一，尤其在流感流行季节高发。流感病毒感染人体后，会刺激机体免疫系统产生反应，导致体温调节中枢紊乱引起发烧，同时炎症介质等释放可引发头痛。例如，多项流行病学调查显示，流感患者中约90%会出现发热症状，体温多在38℃-39℃甚至更高，同时伴有明显头痛。儿童感染流感病毒时，发热程度可能相对更高，头痛表现也较为突出，这与儿童自身免疫系统发育尚未完善，病毒感染后炎症反应更强烈有关。
普通感冒病毒：如鼻病毒等引起的普通感冒，也常出现发烧头痛症状。一般体温为低热或中度发热，体温多在37.3℃-38.5℃左右，头痛程度相对流感较轻，但也会影响患者的舒适感。成年人和儿童均可发病，儿童由于鼻腔等解剖结构特点，感染后更易出现鼻塞等症状，进而可能加重头痛不适。
细菌感染：
肺炎链球菌感染：可引起肺炎等疾病，当感染累及机体时，细菌产生的毒素等物质会引发机体的免疫炎症反应。患者会出现高热，体温可超过39℃，同时伴有头痛，头痛可能较为剧烈，还常伴有咳嗽、咳痰等症状。在老年人和儿童等免疫力较低人群中，肺炎链球菌感染更易导致严重的发烧头痛症状，因为他们的机体防御机制相对较弱，感染后炎症反应更容易扩散和加重。
化脓性脑膜炎：由细菌感染脑膜引起，是较为严重的感染性疾病。患者会出现持续高热，体温可达39℃以上，同时头痛剧烈，常伴有呕吐、颈项强直等症状。儿童患化脓性脑膜炎时，由于囟门未闭等特点，头痛表现可能不太典型，但发热往往较为突出，需要及时诊断和治疗，否则可能危及生命。
非感染性因素
自身免疫性疾病：
系统性红斑狼疮：这是一种自身免疫性结缔组织病，患者体内存在自身抗体，可累及多个系统。部分患者会出现发热头痛症状，发热可为低热或中度发热，头痛多为间歇性或持续性。女性患者发病率高于男性，可能与女性的内分泌等因素有关。在病情活动期，自身免疫反应强烈，更容易出现发烧头痛等症状，需要长期监测和规范治疗来控制病情。
类风湿关节炎：主要累及关节，但也可出现全身症状。部分患者会有发热表现，体温一般为低热，同时伴有头痛。其发病与自身免疫异常有关，女性发病相对较多，在疾病活动时，炎症反应可导致身体多个部位出现不适，包括发烧头痛。
中暑：在高温环境下，人体体温调节中枢功能紊乱、汗腺功能衰竭和水电解质丢失过多等引起中暑。轻症中暑患者可出现低热、头痛、头晕、口渴、多汗等症状；重症中暑时，体温可迅速升高，可达40℃以上，同时头痛剧烈，还可伴有恶心、呕吐、昏迷等严重表现。长时间处于高温环境工作或活动的人群，如户外劳动者、长时间在高温车间工作的工人等，更容易发生中暑导致发烧头痛。儿童由于体温调节功能尚未发育完善，在高温环境下也更易中暑出现发烧头痛情况，需要特别注意防暑降温。
颅脑外伤：头部受到外力撞击等导致颅脑外伤时，可能出现发烧头痛症状。外伤后由于局部组织损伤、出血等，可引起炎症反应和颅内压变化，从而导致发热和头痛。如果是轻度颅脑外伤，可能只是低热和轻微头痛；严重颅脑外伤时，发热可能较高，头痛剧烈，还可能伴有意识障碍等更严重的症状。无论是成年人还是儿童，颅脑外伤后都需要密切观察是否有发烧头痛等症状出现，以便及时发现可能的颅内并发症。
恶性肿瘤：某些恶性肿瘤患者会出现癌性发热，同时可能伴有头痛。例如，脑肿瘤患者由于肿瘤组织压迫或侵犯周围脑组织，可引起颅内压增高，导致头痛，同时肿瘤坏死等可引起发热。肿瘤引起的发热可为低热或中度发热，头痛程度因肿瘤的部位和进展情况而异。老年人患恶性肿瘤时，发烧头痛症状可能不典型，需要结合其他检查来明确诊断。
