新生儿黄疸分为生理性和病理性，生理性黄疸因胆红素生成相对过多及肝脏对胆红素代谢功能不足引发；病理性黄疸包括胆红素生成过多（如红细胞增多症、同族免疫性溶血、感染、肠肝循环增加等）、肝脏胆红素代谢障碍（如肝炎综合征、先天性代谢缺陷病等）、胆汁排泄障碍（如先天性胆道闭锁、新生儿肝炎等）导致。
一、生理性黄疸
1.胆红素生成相对过多
胎儿在宫内处于低氧环境，红细胞数量代偿性增多，出生后血氧含量增高，过多的红细胞被破坏，使胆红素生成增加。新生儿每日生成胆红素量约为成人的2倍多，这是因为新生儿红细胞寿命相对短（约70-90天，而成人红细胞寿命约120天），且血红蛋白的分解速度快，导致胆红素产生增多。
新生儿肝细胞内Y、Z蛋白含量低，出生后才逐渐增加，生后1周内Y蛋白含量仅为成人的50%，Z蛋白为成人的不足30%，影响了肝细胞对胆红素的摄取能力。
2.肝脏对胆红素的代谢功能不足
新生儿肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UDPGT）的量及活性不足，仅为成人的1%-2%，且酶的活性受多种因素影响，如缺氧、感染等，使得未结合胆红素不能充分转化为结合胆红素。结合胆红素是水溶性的，可以通过胆汁排泄，由于新生儿肝脏UDPGT活性低，导致胆红素代谢能力受限。
新生儿肝脏对胆红素的排泄功能也不完善，肝细胞将结合胆红素排泄到肠道的能力较差，容易出现胆汁排泄障碍，尤其是早产儿，其肝脏排泄胆红素的功能更不成熟。
二、病理性黄疸
1.胆红素生成过多
红细胞增多症：常见于分娩过程中胎盘-脐带输血、双胎输血等情况，使新生儿红细胞数增多，导致胆红素生成过多。例如，当新生儿有脐带结扎延迟，从胎盘额外获得较多血液时，红细胞数量增加，胆红素产生相应增多。
同族免疫性溶血：如ABO血型不合、Rh血型不合等。以ABO血型不合为例，母亲血型为O型，胎儿血型为A型或B型时，母亲体内的抗A或抗B抗体可通过胎盘进入胎儿体内，引起胎儿红细胞破坏，从而使胆红素生成增加。据统计，ABO血型不合引起的溶血约占新生儿溶血病的85%左右。
感染：细菌、病毒等感染可导致新生儿出现败血症等情况，感染时红细胞破坏增多，同时感染还可影响肝脏的功能，进一步加重胆红素代谢的异常。例如，金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等感染引起的败血症，可使新生儿体内炎症反应增强，导致红细胞破坏增加，胆红素生成增多。
肠肝循环增加：先天性肠道闭锁、先天性幽门肥厚、巨结肠等肠道疾病可导致胎便排出延迟，使胆红素重吸收增加。因为正常情况下，肠道内的胆红素可被肠道细菌还原成尿胆原，大部分尿胆原随粪便排出，小部分被肠道重吸收经门静脉回到肝脏。但肠道疾病导致胎便排出延迟时，胆红素在肠道内停留时间延长，重吸收增多，从而使血中胆红素水平升高。
2.肝脏胆红素代谢障碍
肝炎综合征：多由病毒引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等感染新生儿肝脏，导致肝细胞受损，影响其对胆红素的摄取、结合和排泄功能。例如，巨细胞病毒感染可引起新生儿肝炎，导致肝脏功能异常，胆红素代谢障碍。
先天性代谢缺陷病：如葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G-6-PD）缺乏症，是一种X连锁不完全显性遗传病，由于G-6-PD缺陷，红细胞易被氧化破坏，导致胆红素生成过多；还有酪氨酸血症等，可影响胆红素的代谢过程。
3.胆汁排泄障碍
先天性胆道闭锁：这是一种较为严重的肝胆系统疾病，可分为肝内型和肝外型，肝外型相对多见。胆道闭锁导致胆汁排出受阻，结合胆红素不能正常排入肠道，反流入血，引起血中结合胆红素升高。目前认为可能与胚胎发育过程中胆道空化不全等因素有关。
新生儿肝炎：除了上述肝炎综合征的情况外，一些新生儿肝炎还可导致胆汁排泄障碍，肝细胞肿胀等影响胆汁的排泄，使胆红素在体内积聚。
