头皮长毛囊炎的原因包括细菌感染（如金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌易在头皮皮肤屏障受损或局部环境改变时感染毛囊）、真菌因素（马拉色菌在头皮油脂分泌旺盛人群易大量繁殖刺激毛囊引发）、皮肤卫生状况（清洁不当致污垢等堆积或过度清洁损伤头皮屏障增加风险）、机体免疫力因素（一般人群免疫力低下及儿童免疫系统未熟等易发病）、毛发相关因素（头发过长致头皮不透气及剃须损伤易引发）。
一、细菌感染相关因素
金黄色葡萄球菌：是引起头皮毛囊炎常见的致病菌。正常皮肤表面可能存在少量金黄色葡萄球菌，但当头皮皮肤屏障受损时，如头皮有擦伤、搔抓等情况，金黄色葡萄球菌就容易侵入毛囊引发感染。例如，儿童活泼好动，头皮容易受到外力碰撞或搔抓导致皮肤损伤，从而增加金黄色葡萄球菌感染引发毛囊炎的风险；成年人如果经常熬夜、生活不规律导致身体免疫力下降，此时头皮皮肤的防御能力减弱，也易受金黄色葡萄球菌侵袭。
表皮葡萄球菌：也是头皮毛囊炎的常见病原菌之一。它通常寄居于皮肤表面，当头皮局部环境改变，如出汗较多、不注意头皮清洁等，表皮葡萄球菌可能大量繁殖并感染毛囊。对于长期处于高温环境工作的人群，如建筑工人等，头皮出汗多且清洁不及时，就容易滋生表皮葡萄球菌引发毛囊炎；女性如果长期使用油性较大的护发产品，可能会影响头皮的正常代谢，为表皮葡萄球菌的生长创造条件。
二、真菌因素
马拉色菌：属于条件致病性真菌，在头皮油脂分泌旺盛的人群中容易大量繁殖。头皮油脂分泌过多，为马拉色菌提供了丰富的营养物质，马拉色菌的代谢产物会刺激毛囊，导致毛囊炎的发生。青春期少年由于体内激素水平变化，头皮油脂分泌往往较多，马拉色菌感染引发头皮毛囊炎的情况较为常见；一些患有内分泌疾病，如多囊卵巢综合征的女性，体内激素失衡也会导致头皮油脂分泌异常，增加马拉色菌感染的几率。
三、皮肤卫生状况
清洁不当：长期不洗头会使头皮上的污垢、油脂、灰尘等堆积，容易堵塞毛囊口，为细菌和真菌的滋生创造有利条件。例如，一些老年人行动不便，洗头频率较低，就容易出现头皮毛囊炎；儿童如果家长护理不到位，不能保证定期给孩子清洁头皮，也容易引发头皮毛囊炎。
过度清洁：虽然清洁不当不好，但过度清洁也可能破坏头皮的正常菌群和皮肤屏障。比如频繁使用刺激性强的洗发水，过度搓洗头皮，会损伤头皮的角质层，使头皮的防御功能下降，从而增加毛囊炎的发生风险。一些头皮敏感的人群，如果过度清洁头皮，更容易出现这种情况。
四、机体免疫力因素
一般人群：当人体整体免疫力低下时，如患有慢性疾病（如糖尿病等）、长期服用免疫抑制剂、过度劳累、睡眠不足等情况，头皮毛囊抵御细菌和真菌感染的能力会下降，容易发生毛囊炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，头皮毛囊感染的几率相对较高；长期熬夜的上班族，睡眠不足导致身体免疫力下降，也容易出现头皮毛囊炎。
儿童群体：儿童免疫系统尚未完全发育成熟，相对成年人更容易出现免疫力低下的情况。儿童如果患有先天性免疫缺陷疾病，或者因其他疾病导致免疫力受损，头皮毛囊炎的发生概率会增加。而且儿童活泼好动，皮肤容易受伤，一旦皮肤屏障受损，在免疫力相对较低的情况下，就更易引发头皮毛囊炎。
五、毛发相关因素
头发过长：过长的头发容易使头皮局部不透气，汗液、油脂等不易散发，营造了有利于细菌和真菌滋生的环境。例如，一些留长发的女性，如果不注意头皮的通风，就容易长毛囊炎；儿童头发过长且不经常梳理清洁，也容易出现头皮毛囊炎问题。
剃须损伤：男性如果剃须时操作不当，如剃须刀不锋利、剃须过于频繁等，容易造成头皮微小损伤，从而为细菌侵入毛囊提供途径，引发毛囊炎。尤其是一些皮肤较为敏感的男性，剃须后更容易出现头皮毛囊炎。
