器质性便秘是由肠道或邻近器官的器质性疾病、结构异常或功能障碍引起的便秘，其病因明确且持续存在，与功能性便秘（无器质性病变）有本质区别。
肠道结构异常性便秘：由肠道先天发育异常或后天损伤导致通道狭窄、梗阻。如先天性巨结肠（因肠神经节细胞缺如致远端肠管痉挛梗阻）、肠粘连（腹部手术后腹腔内纤维瘢痕组织牵拉肠管）、肠道肿瘤（结直肠癌等占位性病变挤压肠腔），此类便秘常伴随腹痛、腹胀、呕吐等梗阻症状。
肠道动力障碍性便秘：因肠道平滑肌或神经调节异常致蠕动能力下降。糖尿病性肠病（长期高血糖引发自主神经病变，肠平滑肌收缩力减弱）、甲状腺功能减退（甲状腺激素不足致肠道蠕动减慢）、硬皮病（肠道纤维化使肠壁弹性降低）等，患者常表现为粪便干结、排便次数显著减少。
神经系统疾病相关性便秘：中枢或外周神经病变直接影响排便反射。帕金森病（黑质多巴胺能神经元减少，抑制性神经递质失衡）、多发性硬化（脊髓白质脱髓鞘损伤排便中枢）、脑卒中（大脑皮层或脑干损伤阻断排便信号传导），老年患者因神经退行性改变更易合并此类便秘。
内分泌与代谢性疾病及盆底功能障碍性便秘：内分泌紊乱或盆底结构功能异常导致排便困难。甲状腺功能亢进（虽常伴腹泻，但部分患者因脱水或药物副作用引发便秘）、糖尿病（高血糖引发渗透性利尿或肠道菌群紊乱）、盆底肌痉挛综合征（盆底肌持续性收缩，无法配合排便动作）、直肠脱垂（盆底支持结构松弛，粪便滞留），女性因妊娠子宫压迫、产后盆底肌松弛更易出现此类问题。
特殊人群注意事项：婴幼儿器质性便秘（如先天性巨结肠）需尽早手术干预，避免长期便秘致营养不良；老年人因基础疾病多（高血压、糖尿病），用药需谨慎，优先非药物干预（饮食调整、适度运动）；女性孕期便秘与激素变化及子宫压迫有关，建议增加膳食纤维摄入；盆底功能障碍患者（如产后女性）可进行凯格尔运动改善盆底肌协调性，儿童器质性便秘需避免使用刺激性泻药，优先通过饮食和排便习惯培养缓解。
