粪便异常发臭可能由多种系统问题导致，如消化系统的肠道菌群失调、消化不良、肠道寄生虫感染；肝胆系统的肝脏疾病、胆道疾病；其他系统的内分泌系统疾病（如糖尿病酮症酸中毒）、系统性疾病（如尿毒症），不同人群因自身特点在相关问题上有不同表现。
一、消化系统问题相关
1.肠道菌群失调
正常情况下，肠道内有多种有益菌群维持肠道正常功能。当肠道菌群失调时，有害菌增多或有益菌减少，会导致食物在肠道内的消化过程异常。例如，一些产气荚膜梭菌等可能会分解肠道内的食物残渣，产生有特殊臭味的气体，从而使排出的粪便有异常臭味。研究表明，肠道菌群失调可由多种因素引起，如长期使用广谱抗生素、饮食不均衡（长期高油高脂低纤维饮食等）、肠道感染等情况。对于不同年龄人群，婴幼儿肠道菌群尚在发育阶段，若喂养不当或感染等易出现菌群失调；老年人肠道功能衰退，也更容易发生菌群失调导致屎臭。
2.消化不良
当胃肠蠕动减慢或者消化酶分泌不足时，会出现消化不良。比如，胃动力不足会使食物在胃内停留时间过长，不能充分消化就进入肠道。未充分消化的食物在肠道内被细菌分解，产生带有异味的物质，导致粪便发臭。不同性别在消化功能上可能存在一定差异，但总体来说，消化不良是一个较为常见的导致屎臭的原因。对于有不良生活方式的人群，如长期熬夜、缺乏运动的人，更容易出现消化不良情况；有基础病史的人群，如患有糖尿病影响胃肠神经功能的患者，也易发生消化不良进而使粪便异常发臭。
3.肠道寄生虫感染
如蛔虫、绦虫等肠道寄生虫在肠道内寄生，会夺取人体营养，并且其代谢产物等会影响肠道的正常消化吸收功能。寄生虫在肠道内活动还可能破坏肠道黏膜，导致肠道内环境改变，使得粪便产生异常臭味。儿童由于卫生习惯相对较差等原因，肠道寄生虫感染的风险相对较高，若出现屎臭且伴有腹痛、消瘦等症状时，需考虑肠道寄生虫感染的可能；成年人也可能因接触污染的环境等感染肠道寄生虫。
二、肝胆系统问题相关
1.肝脏疾病
肝脏是人体重要的代谢器官，当肝脏出现问题时，如肝炎、肝硬化等。肝脏对胆红素的代谢功能发生障碍，会导致胆红素代谢异常，部分胆红素会通过肠道排出，影响粪便的性状和气味。例如，肝炎患者由于肝细胞受损，胆红素代谢途径受阻，粪便可能会颜色变浅且伴有异常臭味。不同年龄的肝脏疾病患者情况不同，儿童患肝脏疾病可能与先天性胆道发育异常等有关，而老年人肝脏疾病多与长期饮酒、病毒感染后迁延不愈等有关；男性和女性在肝脏疾病的易患因素上有一定差异，男性长期大量饮酒导致酒精性肝病的风险相对较高，女性可能因自身免疫等因素患肝脏疾病。
2.胆道疾病
胆道梗阻等胆道疾病会影响胆汁的排出。胆汁是帮助消化脂肪等物质的重要液体，胆道梗阻时，胆汁不能正常进入肠道参与消化过程，脂肪消化不完全，在肠道内被细菌分解产生异常气味，导致粪便发臭。如胆结石引起的胆道梗阻，会使粪便性状改变且气味异常。对于有胆道疾病家族史的人群，需要更加关注粪便气味等变化；老年人由于胆道系统容易出现结石等病变，也是胆道疾病的高发人群，应注意监测粪便情况。
三、其他系统问题相关
1.内分泌系统疾病
例如糖尿病酮症酸中毒时，人体代谢紊乱，脂肪分解增加，产生大量酮体，通过尿液和粪便排出时会使粪便带有特殊的烂苹果样臭味。糖尿病患者若血糖控制不佳出现酮症酸中毒情况时，粪便气味会有明显改变。不同年龄段的糖尿病患者发生酮症酸中毒的风险不同，儿童糖尿病相对较少见，但一旦发生酮症酸中毒病情较为危急；成年人糖尿病患者若不规律用药、饮食控制不佳等易出现酮症酸中毒；老年人糖尿病患者由于身体机能衰退，对血糖等的调节能力更差，也易发生酮症酸中毒导致粪便异常发臭。
2.系统性疾病
一些全身性的慢性疾病，如尿毒症等，由于肾脏功能严重受损，体内的毒素不能正常排出，会通过肠道排出，影响粪便的气味。尿毒症患者除了粪便有异常臭味外，还会伴有其他一系列症状，如水肿、贫血等。不同年龄的尿毒症患者，儿童可能因先天性肾脏疾病等导致，成年人可能因慢性肾炎等迁延不愈发展而来，老年人则多因长期的高血压、糖尿病等引起的慢性肾病进展为尿毒症；男性和女性在尿毒症的病因方面可能有一定差异，但总体都是肾脏功能严重受损导致毒素蓄积影响粪便气味。
