全身肌肉疼可能由多种情况引起，包括感染性疾病（如流感、肺炎）、自身免疫性疾病（如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮）、内分泌及代谢性疾病（如甲状腺功能亢进、糖尿病酮症酸中毒）、剧烈运动后以及药物副作用等，不同情况中全身肌肉疼的伴随症状、好发人群等各有差异。
肺炎：细菌、病毒等病原体感染肺部引发肺炎时，也可能出现全身肌肉疼的情况，同时伴有咳嗽、咳痰、发热等表现。不同年龄的肺炎患者，全身肌肉疼的表现可能因个体差异和感染程度而有所不同，老年人患肺炎时全身症状可能相对不典型，但全身肌肉疼仍可能存在。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎：是一种自身免疫性疾病，主要累及关节，也可出现全身肌肉疼的症状，还伴有关节肿胀、疼痛、畸形等。多见于中老年人，女性发病率相对较高。其发病机制与自身免疫紊乱导致关节及周围组织炎症有关，炎症反应可波及全身肌肉，引起肌肉疼痛不适。
系统性红斑狼疮：好发于育龄女性，是一种累及多系统的自身免疫性疾病，全身肌肉疼是常见症状之一，还可出现面部红斑、口腔溃疡、脱发、关节痛等多系统表现。自身抗体的产生导致全身多器官、多系统受损，肌肉受累时就会出现疼痛。
内分泌及代谢性疾病相关
甲状腺功能亢进：甲状腺激素分泌过多，机体处于高代谢状态，可出现全身肌肉疼、乏力、多汗、心慌、手抖等症状。各年龄段均可发病，不同年龄患者的表现可能有所差异，年轻人患甲亢时全身肌肉疼可能与代谢亢进导致的肌肉能量代谢异常有关。
糖尿病酮症酸中毒：糖尿病患者血糖控制不佳时可能出现糖尿病酮症酸中毒，表现为全身肌肉疼、乏力、呼吸深快、呼气有烂苹果味等。多见于糖尿病患者，尤其是1型糖尿病患者血糖控制不良时，由于体内酮体堆积，引起机体代谢紊乱，从而导致肌肉疼痛。
其他情况
剧烈运动后：长时间或高强度的剧烈运动，会使肌肉产生大量乳酸等代谢产物，也可导致全身肌肉疼，一般休息后可逐渐缓解。各年龄段人群都可能发生，年轻人运动后出现全身肌肉疼较为常见，儿童在过度运动后也可能出现类似情况，但通常恢复相对较快。
药物副作用：某些药物在使用过程中可能出现全身肌肉疼的副作用，如他汀类药物，在降血脂治疗时可能导致肌肉疼痛等不良反应。不同人群对药物副作用的敏感程度不同，老年人由于肝肾功能减退，可能更容易出现药物相关的全身肌肉疼等不良反应。
