螺旋藻可能致部分个体过敏出现皮肤或呼吸道症状，还会引发胃肠不适，孕妇哺乳期女性、儿童及免疫系统异常者食用需谨慎，且可能与某些药物相互作用，正在服药人群食用前应咨询医生评估风险。
一、过敏反应
部分个体可能对螺旋藻中的蛋白质等成分产生过敏反应，表现为皮肤症状，如出现皮疹、瘙痒，严重时可能出现呼吸道症状，如呼吸困难、喉头水肿等。这是因为人体免疫系统将螺旋藻中的某些物质识别为外来抗原，引发免疫应答导致过敏表现。不同过敏体质者发生过敏的概率不同，过敏体质人群接触螺旋藻后更易出现此类副作用。
二、消化不适
食用螺旋藻可能引起胃肠道不适，常见症状包括恶心、呕吐、腹胀、腹泻等。这是由于螺旋藻进入胃肠道后，可能刺激胃肠道黏膜，影响胃肠道正常的消化吸收功能。一般健康人群在正常食用量下可能较少出现，但胃肠功能较弱者食用后更易发生此类消化不适症状。
三、对特殊人群的影响
1.孕妇与哺乳期女性：目前关于孕妇和哺乳期女性食用螺旋藻的安全性研究相对有限，为避免可能存在的未知风险，不建议随意食用螺旋藻。因为其对胎儿或婴儿的影响尚未完全明确，从谨慎角度出发，需谨慎对待。
2.儿童：儿童的身体机能尚未完全发育成熟，螺旋藻对儿童的安全性和适宜剂量缺乏充分的临床验证，且儿童消化系统等各方面较为脆弱，食用螺旋藻可能带来未知的健康风险，所以应避免低龄儿童食用螺旋藻。
3.免疫系统异常者：螺旋藻具有一定免疫调节作用，对于本身免疫系统异常的人群，如自身免疫性疾病患者等，可能因螺旋藻的免疫调节作用干扰原本异常的免疫状态，导致病情波动或出现不良影响，这类人群食用需格外谨慎，应在医生指导下权衡利弊后再决定是否食用。
四、药物相互作用风险
螺旋藻可能与某些药物发生相互作用，例如可能影响抗凝药物的效果，增加出血风险；也可能与降糖药物相互作用，干扰血糖的控制等。由于个体用药情况差异较大，正在服用药物的人群在食用螺旋藻前应咨询医生，评估可能存在的药物相互作用风险，以避免对健康造成不利影响。
